More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4670 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  90.83 
 
 		 240 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  84.1 
 
 		 239 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  83.68 
 
 		 239 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  80.75 
 
 		 239 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  84.58 
 
 		 233 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  73.22 
 
 		 239 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1839  GntR family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 230 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 229 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  56.44 
 
 		 227 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  56.44 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  56.44 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1233  transcriptional regulator, GntR family  55.8 
 
 		 230 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2793  GntR family transcriptional regulator  56.7 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  54.11 
 
 		 242 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3115  GntR family transcriptional regulator  54.02 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2028  GntR family transcriptional regulator  53.39 
 
 		 260 aa  238  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3426  GntR family transcriptional regulator  52.77 
 
 		 243 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.100034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2156  transcriptional regulator, GntR family  53.57 
 
 		 243 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  51.56 
 
 		 230 aa  228  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1855  GntR family transcriptional regulator  53.67 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4050  GntR family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 230 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5951  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0388156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1523  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 223 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 223 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  31.21 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 222 aa  99.4  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 226 aa  99  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 222 aa  98.6  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  30.22 
 
 		 214 aa  98.6  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  31.22 
 
 		 228 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 235 aa  98.2  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 221 aa  98.2  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 231 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 230 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 230 aa  98.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  32.95 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 244 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 229 aa  92.4  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 222 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 235 aa  92  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 242 aa  91.7  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 228 aa  91.7  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0200  transcriptional regulator, GntR family  31.64 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 223 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  27.14 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 223 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 241 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 223 aa  89  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 233 aa  89  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>