More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4659 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  49 
 
 
730 aa  697    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  48.65 
 
 
780 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  48.82 
 
 
747 aa  675    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  48.56 
 
 
766 aa  719    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  49.93 
 
 
759 aa  709    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  49.58 
 
 
762 aa  662    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  50.14 
 
 
730 aa  710    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  49.43 
 
 
730 aa  700    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  48.68 
 
 
748 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
747 aa  1531    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  49.29 
 
 
730 aa  701    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  48.85 
 
 
768 aa  674    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  48.82 
 
 
748 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  49.19 
 
 
773 aa  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  49.41 
 
 
759 aa  702    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  48.61 
 
 
747 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  48.68 
 
 
772 aa  659    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  48.96 
 
 
748 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  49.13 
 
 
749 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  48.34 
 
 
747 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  49.29 
 
 
730 aa  700    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  48.21 
 
 
747 aa  665    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  49.57 
 
 
731 aa  702    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  48.66 
 
 
760 aa  658    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  49.71 
 
 
731 aa  706    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  48.57 
 
 
763 aa  661    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  48.82 
 
 
748 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  48.96 
 
 
747 aa  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  44.02 
 
 
753 aa  643    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  48.13 
 
 
753 aa  713    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  48.34 
 
 
747 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  50 
 
 
731 aa  710    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  42.2 
 
 
826 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  43.9 
 
 
741 aa  595  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0044  TonB-dependent siderophore receptor  43.28 
 
 
794 aa  590  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  43.68 
 
 
769 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  44.58 
 
 
741 aa  569  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  43.45 
 
 
740 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  42.38 
 
 
776 aa  548  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  39.33 
 
 
724 aa  504  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  37.99 
 
 
731 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  39.73 
 
 
765 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  36.98 
 
 
751 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  37.64 
 
 
733 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  36.44 
 
 
732 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  35.62 
 
 
794 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  36.57 
 
 
733 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  37.11 
 
 
764 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  36.03 
 
 
793 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  36.56 
 
 
733 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  35.27 
 
 
760 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  36.12 
 
 
742 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  36.12 
 
 
742 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  35.27 
 
 
760 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  35.27 
 
 
760 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.167931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  35.27 
 
 
760 aa  406  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  35.05 
 
 
733 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  35.01 
 
 
760 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  35.14 
 
 
760 aa  405  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  35.14 
 
 
760 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  35.27 
 
 
760 aa  406  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12330  TonB-dependent siderophore receptor  35.89 
 
 
769 aa  405  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  37.04 
 
 
751 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  34.08 
 
 
793 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  35.97 
 
 
821 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  34.52 
 
 
733 aa  399  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  34.23 
 
 
769 aa  391  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0095  TonB-dependent siderophore receptor  36.38 
 
 
823 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  36.18 
 
 
753 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3540  putative outer membrane TonB-dependent receptor  33.8 
 
 
805 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0614736  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1637  catecholate siderophore receptor Fiu  33.77 
 
 
763 aa  385  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.824429  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1708  catecholate siderophore receptor Fiu  33.12 
 
 
779 aa  385  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  35.58 
 
 
745 aa  382  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  35.43 
 
 
754 aa  379  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  32.43 
 
 
743 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  35.85 
 
 
732 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  35.28 
 
 
732 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1314  putative TonB-dependent receptor protein  34.85 
 
 
843 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.711074 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0700  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 
785 aa  360  7e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.241055 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1513  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 
859 aa  358  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.691941  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  33.64 
 
 
734 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7102  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 
790 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3225  TonB-dependent siderophore receptor  32.92 
 
 
803 aa  337  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1524  TonB-dependent siderophore receptor  30.74 
 
 
847 aa  332  1e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0530  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 
767 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.898854  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0514  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 
768 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400369  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  34.14 
 
 
736 aa  327  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 
777 aa  326  8.000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 
734 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  31.87 
 
 
727 aa  310  6.999999999999999e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  30.69 
 
 
770 aa  307  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  31.83 
 
 
710 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 
710 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03559  putative outer membrane receptor for iron transport  28.74 
 
 
761 aa  303  7.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143456  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  33.83 
 
 
719 aa  294  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2275  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 
779 aa  292  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00175316  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0611  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 
773 aa  289  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000075991  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 
720 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1948  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 
815 aa  286  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 
737 aa  273  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>