More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4635 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  100 
 
 
226 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  71.73 
 
 
212 aa  297  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  57.22 
 
 
222 aa  225  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 
194 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
210 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 
216 aa  52.4  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
335 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
291 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
220 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
222 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 
268 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
285 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1941  hypothetical protein  28.17 
 
 
200 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
195 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 
178 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
218 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0219  regulatory protein, TetR  38.98 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
202 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 
186 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
275 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 
212 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 
216 aa  48.9  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 
248 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
195 aa  48.9  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 
191 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.72 
 
 
215 aa  48.9  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
208 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
211 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 
202 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  23.88 
 
 
191 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
213 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 
198 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
203 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  27.85 
 
 
193 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 
200 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2806  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00749048  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
195 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
193 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
193 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
193 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
245 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
193 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
233 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  22.69 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
196 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  28.36 
 
 
205 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 
193 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
283 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  38.27 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 
190 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  25.97 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
184 aa  47  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>