More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4610 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  645  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  68.42 
 
 
337 aa  441  1e-122  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  65.03 
 
 
326 aa  431  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  59.4 
 
 
333 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  55.27 
 
 
314 aa  359  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  53.67 
 
 
349 aa  357  2e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  51.83 
 
 
331 aa  345  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  50.33 
 
 
334 aa  332  4e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  52.51 
 
 
328 aa  332  7e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  50.83 
 
 
332 aa  330  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  49 
 
 
339 aa  328  5e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  50.65 
 
 
339 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  50.17 
 
 
325 aa  320  1e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  50.17 
 
 
333 aa  313  3e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  46.97 
 
 
330 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  46.67 
 
 
330 aa  307  2e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.25 
 
 
330 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.75 
 
 
328 aa  299  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  48.32 
 
 
339 aa  298  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  47.51 
 
 
324 aa  298  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  45.28 
 
 
327 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.33 
 
 
330 aa  297  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  45.09 
 
 
328 aa  295  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5000  hypothetical protein  46.91 
 
 
325 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  45.37 
 
 
325 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  45.73 
 
 
333 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  47.49 
 
 
325 aa  291  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  44.94 
 
 
371 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.56 
 
 
328 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.56 
 
 
328 aa  287  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  47.3 
 
 
324 aa  286  3e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46.5 
 
 
336 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.75 
 
 
333 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  45.82 
 
 
326 aa  284  1e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.82 
 
 
323 aa  283  3e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  44.79 
 
 
326 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  45.66 
 
 
325 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.55 
 
 
333 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.28 
 
 
344 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  46.67 
 
 
342 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  44.88 
 
 
333 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  43.97 
 
 
335 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.51 
 
 
314 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  43.96 
 
 
338 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  42.42 
 
 
346 aa  275  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  44.26 
 
 
320 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  46.1 
 
 
349 aa  275  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  42.41 
 
 
325 aa  275  1e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  45 
 
 
327 aa  274  1e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  45 
 
 
325 aa  274  1e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.51 
 
 
360 aa  274  2e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  44.97 
 
 
322 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.05 
 
 
325 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  44 
 
 
323 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  43.65 
 
 
323 aa  273  4e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.95 
 
 
339 aa  272  5e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  44.74 
 
 
325 aa  272  5e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.77 
 
 
339 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  44.34 
 
 
335 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  43.55 
 
 
328 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.93 
 
 
327 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  43.87 
 
 
332 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  44.97 
 
 
332 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.77 
 
 
328 aa  269  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.9 
 
 
345 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  44.63 
 
 
336 aa  269  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.9 
 
 
345 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  44.97 
 
 
355 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  45.61 
 
 
330 aa  269  6e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  42.04 
 
 
329 aa  268  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  41.77 
 
 
332 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  42.38 
 
 
322 aa  267  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 
331 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.31 
 
 
335 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0645  hypothetical protein  44.3 
 
 
331 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.14 
 
 
339 aa  266  3e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  41.88 
 
 
325 aa  266  3e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  7.81341e-10 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  42.46 
 
 
322 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  4.67968e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4432  hypothetical protein  44.77 
 
 
324 aa  265  6e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65696  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  42.06 
 
 
322 aa  265  6e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.15 
 
 
327 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  43.93 
 
 
331 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  43.23 
 
 
339 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  41.54 
 
 
332 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.97 
 
 
324 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  42.86 
 
 
353 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  42.02 
 
 
338 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.31 
 
 
328 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  41.43 
 
 
322 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.9 
 
 
336 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.62 
 
 
330 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.96 
 
 
332 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.68 
 
 
327 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  42.76 
 
 
330 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  42.55 
 
 
353 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6157  hypothetical protein  45.39 
 
 
322 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  44.51 
 
 
321 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  41.88 
 
 
322 aa  263  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  45.39 
 
 
335 aa  262  5e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44.82 
 
 
330 aa  262  5e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>