272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4542 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  100 
 
 
301 aa  627  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  69.04 
 
 
304 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  64.31 
 
 
295 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  61.77 
 
 
305 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  59.54 
 
 
301 aa  358  6e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  60.93 
 
 
297 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  47.12 
 
 
303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  49.83 
 
 
306 aa  282  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  51.8 
 
 
282 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2147  taurine dioxygenase  50.53 
 
 
282 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  50 
 
 
280 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  48.41 
 
 
285 aa  276  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  49.28 
 
 
280 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  49.28 
 
 
299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  49.82 
 
 
282 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  49.11 
 
 
282 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1605  taurine dioxygenase  50.36 
 
 
282 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.437386  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1586  taurine dioxygenase  50.36 
 
 
282 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4841  taurine dioxygenase  50 
 
 
282 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0039228  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  48.56 
 
 
281 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1717  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  48.92 
 
 
282 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  46.24 
 
 
281 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  49.29 
 
 
299 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  48.04 
 
 
282 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1351  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  51.06 
 
 
282 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2043  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  51.06 
 
 
282 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2333  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  51.06 
 
 
282 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1066  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  50.71 
 
 
282 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  46.24 
 
 
281 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3100  TauD/TfdA family dioxygenase  50.35 
 
 
282 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1440  taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family protein  50.35 
 
 
282 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  48.58 
 
 
282 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  43.37 
 
 
307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  42.52 
 
 
295 aa  232  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  38.28 
 
 
283 aa  219  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  38.81 
 
 
283 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  38.81 
 
 
283 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  38.28 
 
 
283 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  38.28 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  38.28 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  38.28 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  38.28 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  41.45 
 
 
272 aa  216  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  38.41 
 
 
282 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  38.41 
 
 
282 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  38.41 
 
 
282 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  39.72 
 
 
277 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  38.28 
 
 
282 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  36.71 
 
 
283 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  39.37 
 
 
277 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  37.5 
 
 
280 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  39.72 
 
 
277 aa  198  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  36.59 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  39.86 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  39.86 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  39.86 
 
 
277 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  36.93 
 
 
277 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  42.59 
 
 
282 aa  195  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  36.24 
 
 
277 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  37.31 
 
 
270 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  36.88 
 
 
278 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  36.24 
 
 
291 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  38.41 
 
 
304 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  37.13 
 
 
271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  36.74 
 
 
304 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  38.21 
 
 
291 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  37.13 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.63 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  38.11 
 
 
289 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  35.51 
 
 
287 aa  179  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  36.2 
 
 
314 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3279  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  37.91 
 
 
312 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  34.36 
 
 
308 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  34.94 
 
 
308 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  34.94 
 
 
308 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2520  taurine dioxygenase  34.23 
 
 
288 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  36.39 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  36.88 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  34.57 
 
 
308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.77 
 
 
298 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  34.57 
 
 
308 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  34.6 
 
 
308 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  35.69 
 
 
302 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  33.44 
 
 
298 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  36.77 
 
 
305 aa  169  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  32.36 
 
 
299 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  35.58 
 
 
306 aa  168  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  33.55 
 
 
299 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  33.45 
 
 
298 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3086  taurine dioxygenase  34.02 
 
 
290 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.042255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  33.22 
 
 
299 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  33.88 
 
 
299 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  35.79 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  33.22 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  36.82 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  33.67 
 
 
287 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  34.92 
 
 
295 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  37.32 
 
 
281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  34.36 
 
 
302 aa  165  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  34.65 
 
 
315 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>