More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4458 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  77.15 
 
 		 337 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  49.24 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  45.65 
 
 		 333 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  45.29 
 
 		 345 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  50.17 
 
 		 335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  45.1 
 
 		 336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  46.56 
 
 		 305 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  46.2 
 
 		 335 aa  298  7e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  48.17 
 
 		 320 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.65 
 
 		 331 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  43.21 
 
 		 331 aa  292  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  43.21 
 
 		 331 aa  292  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  48.59 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  45.78 
 
 		 325 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  45.11 
 
 		 325 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  45.43 
 
 		 333 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  45.36 
 
 		 328 aa  285  9e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  45.36 
 
 		 328 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.77 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.15 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  46.8 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  43.93 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  45.45 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.23 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.63 
 
 		 339 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  43.81 
 
 		 356 aa  275  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  42.47 
 
 		 334 aa  275  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.28 
 
 		 333 aa  275  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.9 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  43.96 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  42.81 
 
 		 325 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  46.13 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.9 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.44 
 
 		 324 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  45.62 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.43 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  44.15 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.4 
 
 		 326 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.12 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  42.62 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  41.88 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.47 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  44.26 
 
 		 331 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.47 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.37 
 
 		 327 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.49 
 
 		 323 aa  268  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  42.52 
 
 		 335 aa  268  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  45.51 
 
 		 322 aa  268  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.28 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  42.81 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.95 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  43.19 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.49 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  43.42 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.75 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  47.99 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.86 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.69 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.39 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.28 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.67 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.28 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.52 
 
 		 335 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  42.95 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  45.64 
 
 		 322 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 331 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  42.35 
 
 		 335 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.18 
 
 		 325 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  45.21 
 
 		 333 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.27 
 
 		 332 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  43.14 
 
 		 338 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  42.32 
 
 		 330 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.29 
 
 		 327 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  42.94 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.26 
 
 		 345 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.26 
 
 		 345 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  43.61 
 
 		 326 aa  262  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  42.09 
 
 		 344 aa  262  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  42.95 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.22 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  42.59 
 
 		 698 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  44.63 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  41.61 
 
 		 328 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  45.03 
 
 		 335 aa  258  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.17 
 
 		 339 aa  259  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  41.14 
 
 		 328 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  41.72 
 
 		 326 aa  258  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  43.41 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.93 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  42.09 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  43.05 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  41.61 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  40.65 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  40.72 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  41.77 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.67 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.62 
 
 		 355 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  42.02 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  41.12 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>