220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4456 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  100 
 
 
488 aa  956    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  63.99 
 
 
490 aa  571  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  62.89 
 
 
498 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  53.7 
 
 
482 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  48.06 
 
 
487 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  46.44 
 
 
471 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  42.71 
 
 
458 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  40.36 
 
 
468 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  39.03 
 
 
465 aa  280  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  42.55 
 
 
665 aa  279  6e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  40.36 
 
 
468 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  37.18 
 
 
467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  37.18 
 
 
467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  37.18 
 
 
467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  43.14 
 
 
685 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  39.03 
 
 
468 aa  262  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  39.03 
 
 
468 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  39.03 
 
 
468 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  39.03 
 
 
468 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  39.03 
 
 
468 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  41.61 
 
 
680 aa  259  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  41.61 
 
 
680 aa  259  9e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  37.68 
 
 
441 aa  253  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  37.3 
 
 
445 aa  253  8.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  36.69 
 
 
471 aa  252  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  37.25 
 
 
466 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.82 
 
 
447 aa  249  6e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  37.04 
 
 
466 aa  249  6e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  37.04 
 
 
466 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  40 
 
 
678 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  40 
 
 
678 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  40.73 
 
 
669 aa  240  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.19 
 
 
472 aa  237  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.73 
 
 
465 aa  227  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  34.55 
 
 
458 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  36.36 
 
 
668 aa  223  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33 
 
 
479 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  36.72 
 
 
677 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  34.22 
 
 
452 aa  213  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  33.13 
 
 
474 aa  205  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32 
 
 
477 aa  204  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.56 
 
 
657 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.7 
 
 
499 aa  201  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.62 
 
 
452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.68 
 
 
468 aa  197  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  34.5 
 
 
477 aa  193  7e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.15 
 
 
476 aa  190  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  30.4 
 
 
487 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  29.67 
 
 
469 aa  176  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.5 
 
 
457 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.83 
 
 
453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.14 
 
 
457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.48 
 
 
487 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  31.57 
 
 
456 aa  172  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1895  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.09 
 
 
479 aa  172  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.3 
 
 
457 aa  172  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.06 
 
 
475 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.45 
 
 
456 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.89 
 
 
454 aa  170  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.89 
 
 
454 aa  170  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.06 
 
 
473 aa  170  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.17 
 
 
456 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.5 
 
 
456 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  28.83 
 
 
541 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  29.25 
 
 
454 aa  163  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  32.11 
 
 
541 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.63 
 
 
454 aa  159  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  31.67 
 
 
472 aa  158  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.45 
 
 
451 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  28.72 
 
 
454 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.61 
 
 
500 aa  156  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  27.27 
 
 
478 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  30.16 
 
 
507 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  30.16 
 
 
507 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.07 
 
 
502 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.08 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  32.26 
 
 
502 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.26 
 
 
502 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  31.16 
 
 
500 aa  153  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  29.96 
 
 
507 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.71 
 
 
479 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  29.96 
 
 
507 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  27.77 
 
 
477 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  29.96 
 
 
507 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  29.96 
 
 
507 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  29.96 
 
 
507 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.18 
 
 
462 aa  150  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.42 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.92 
 
 
455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.46 
 
 
475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  29.56 
 
 
513 aa  146  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  30.5 
 
 
474 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  30.13 
 
 
441 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  30.13 
 
 
441 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3085  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.37 
 
 
477 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.896986  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  29.4 
 
 
692 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.29 
 
 
505 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  31.54 
 
 
505 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  30.24 
 
 
452 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  28.9 
 
 
495 aa  143  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>