44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4434 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4434  SCO1/SenC family protein  100 
 
 		 260 aa  527  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0517752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  41.05 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  33.62 
 
 		 344 aa  132  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5949  electron transport protein SCO1/SenC  35.43 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0228  electron transport protein SCO1/SenC  35.02 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.133565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  32.64 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  31.76 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  29.75 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  29.75 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  36.92 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  31.75 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  29.75 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  32.72 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  35.9 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  36.41 
 
 		 276 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  32.21 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0829  hypothetical protein  33.01 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  normal  0.121929 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  29.61 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  31.82 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  31.82 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2418  hypothetical protein  31.3 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278371  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  30.81 
 
 		 313 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000175275  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6887  hypothetical protein  29.91 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  27.78 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4181  hypothetical protein  31.05 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5818  hypothetical protein  29.9 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110023  hitchhiker  0.00869837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5012  hypothetical protein  28.43 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  0.137531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  28.06 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  28.78 
 
 		 197 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  25.85 
 
 		 190 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 217 aa  45.4  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2707  hypothetical protein  28.24 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  26.62 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  26.45 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  27.33 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1776  electron transport protein SCO1/SenC  25.55 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254998  normal  0.31988 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  26.09 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  28.97 
 
 		 205 aa  42.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  28.66 
 
 		 210 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 210 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>