85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4431 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  49.19 
 
 		 213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  46.34 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  39.34 
 
 		 175 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  46.93 
 
 		 175 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  45.29 
 
 		 201 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  40.34 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  46.15 
 
 		 172 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  45.39 
 
 		 194 aa  124  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  46.5 
 
 		 175 aa  124  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  43.31 
 
 		 173 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  43.83 
 
 		 175 aa  121  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  45.81 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  38.22 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  39.52 
 
 		 190 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  38.73 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  51.92 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  49.07 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  35.76 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  41.03 
 
 		 499 aa  99  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  40.76 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  40.76 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  38.42 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  40.76 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  38.18 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  34.78 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  33.9 
 
 		 477 aa  71.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  22.66 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  25 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  29.38 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  27.41 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  30.07 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  29.87 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  30.43 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  33.98 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  34.95 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  26.76 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  34.91 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  32.52 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  32.08 
 
 		 394 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  38.2 
 
 		 640 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  24.2 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  33.02 
 
 		 394 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  33.02 
 
 		 394 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  35.79 
 
 		 645 aa  51.6  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  33.67 
 
 		 394 aa  51.2  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  38.37 
 
 		 640 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  38.2 
 
 		 642 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  38.2 
 
 		 642 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  33.03 
 
 		 637 aa  49.3  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  31.68 
 
 		 393 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  34.57 
 
 		 644 aa  48.5  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  35.79 
 
 		 642 aa  47.8  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  32.18 
 
 		 643 aa  47  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  38.71 
 
 		 653 aa  45.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 657 aa  45.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  31.76 
 
 		 268 aa  45.4  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  34.12 
 
 		 546 aa  45.1  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 649 aa  45.1  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  33.71 
 
 		 314 aa  44.7  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  31.07 
 
 		 418 aa  44.7  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  29.36 
 
 		 418 aa  44.7  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  33.7 
 
 		 339 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  31.11 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  34.88 
 
 		 664 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  36.79 
 
 		 687 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  30.59 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  28.04 
 
 		 652 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  32.98 
 
 		 647 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  27.52 
 
 		 390 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  29.36 
 
 		 385 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  33.77 
 
 		 683 aa  42.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  32.58 
 
 		 278 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  27.47 
 
 		 270 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  29.21 
 
 		 113 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  29.21 
 
 		 113 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  30.1 
 
 		 248 aa  42  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  29.47 
 
 		 329 aa  42  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  29.47 
 
 		 388 aa  42  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  33.67 
 
 		 171 aa  41.6  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  32.58 
 
 		 273 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  28.4 
 
 		 101 aa  41.2  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  30.12 
 
 		 385 aa  41.2  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.56 
 
 		 653 aa  41.2  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>