107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4409 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4409  catalase  100 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0318  non-heme catalase KatN  74.13 
 
 		 294 aa  441  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47080  Mn-containing catalase  71.08 
 
 		 291 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1436  catalase  72.28 
 
 		 293 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4798  catalase  71.58 
 
 		 300 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.137059 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2044  Catalase  71.33 
 
 		 290 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000198818 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5520  catalase  73.08 
 
 		 308 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2788  manganese containing catalase  69.58 
 
 		 291 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1858  catalase  69.28 
 
 		 292 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.724494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1921  catalase  69.28 
 
 		 292 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0512858  hitchhiker  0.000184673 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1597  catalase  69.28 
 
 		 292 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.577365 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3129  catalase  70.28 
 
 		 290 aa  418  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1863  catalase  69.28 
 
 		 292 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.958813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1415  catalase  68.94 
 
 		 292 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.449813  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1348  DNA mismatch endonuclease  70.38 
 
 		 298 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3122  Mn-containing catalase  70.38 
 
 		 298 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2997  Mn-containing catalase  70.38 
 
 		 314 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5251  catalase  71.33 
 
 		 301 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5095  catalase  68.53 
 
 		 293 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6729  catalase  70.28 
 
 		 301 aa  407  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1645  catalase  67.12 
 
 		 296 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1578  catalase  70.28 
 
 		 304 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6253  catalase  70.28 
 
 		 304 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3293  Catalase  47.96 
 
 		 326 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2921  Catalase  47.21 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5037  Catalase  45.93 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  45.74 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1673  catalase  47.33 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.849273  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1329  Catalase  43.02 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.714734  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0376  manganese containing catalase  40.84 
 
 		 249 aa  172  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1620  manganese containing catalase  39.18 
 
 		 230 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3384  catalase  40.33 
 
 		 231 aa  163  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000494245  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3821  manganese containing catalase  41.56 
 
 		 230 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00457633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2781  manganese containing catalase  37.97 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1780  Catalase  38.91 
 
 		 205 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0288  manganese containing catalase  36.74 
 
 		 245 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0232  Catalase  43.08 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010197  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0656  manganese containing catalase  42.27 
 
 		 189 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.807783  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4479  cotJC protein  40.72 
 
 		 189 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.163427 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0895  cotJC protein  40.72 
 
 		 189 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000660321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1392  manganese containing catalase  39.58 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0716  manganese containing catalase  40.72 
 
 		 189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000621736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2189  manganese containing catalase  42.42 
 
 		 189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1104  Catalase  39.73 
 
 		 231 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000426374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1864  Catalase  39.45 
 
 		 224 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.299932  normal  0.0213876 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1016  catalase  41.03 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00169796  unclonable  0.00000000343768 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0766  cotJC protein  40.21 
 
 		 189 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000213334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0714  cotJC protein  40.21 
 
 		 189 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298472  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0701  spore coat-associated protein JC  40.21 
 
 		 189 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000246142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0803  spore coat-associated protein JC  40.21 
 
 		 189 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000303709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0967  cotJC protein  40.21 
 
 		 189 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000889969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0857  cotJC protein  40.21 
 
 		 189 aa  139  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0899  cotJC protein  40.21 
 
 		 189 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.71221e-44 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0414  manganese containing catalase  38.02 
 
 		 203 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1213  manganese containing catalase  39.49 
 
 		 190 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.645424  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2165  Catalase  39.18 
 
 		 189 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03960  Catalase  39.68 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00363943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2909  manganese containing catalase  36.41 
 
 		 190 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1600  Catalase  30.74 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23050  manganese containing catalase  36.98 
 
 		 193 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0440  Catalase  39.8 
 
 		 189 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2836  Catalase  31.58 
 
 		 284 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0774925 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0606  catalase  33.6 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0886  catalase  30.89 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1876  manganese containing catalase  30.45 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0934  spore coat peptide assembly protein CotJC  34.48 
 
 		 188 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0072871  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1068  spore coat protein CotJC  33.99 
 
 		 188 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00620626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0221  Catalase  37.7 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5807  Catalase  31.8 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0517  Catalase  29.7 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2898  Catalase  32.79 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.808431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1680  Catalase  29.21 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3979  catalase  31.84 
 
 		 274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5296  Catalase  32.63 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.201236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2775  catalase  31.98 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3002  Catalase  31.98 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0705397  normal  0.0852902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0815  Catalase  32.8 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.683068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1821  catalase  34.01 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  0.0328704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2075  catalase  30.5 
 
 		 285 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6390  catalase  31.02 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1848  Catalase  29.18 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  0.135263 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1877  Catalase  30.8 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1447  manganese containing catalase  33 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20670  Mn-containing catalase  28.63 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1481  manganese containing catalase  29.84 
 
 		 184 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000413774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11980  Mn-containing catalase  29.38 
 
 		 321 aa  89  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2123  catalase, Mn-containing  25.86 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3134  catalase, Mn-containing  26.29 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2914  catalase, Mn-containing  26.29 
 
 		 287 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2882  Mn-containing catalase  25.86 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3134  catalase, Mn-containing  25.86 
 
 		 284 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2839  manganese containing catalase  25.86 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1316  Catalase  27.19 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4594  manganese containing catalase  28.64 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.756991  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4224  manganese containing catalase  28.64 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0292992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4741  manganese containing catalase  27.94 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0681  manganese containing catalase  30.65 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400648  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0729  manganese containing catalase  27.64 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000123231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5727  manganese containing catalase  24.66 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.388852  hitchhiker  0.00719162 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0952  Catalase  28.22 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>