More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4384 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
328 aa  652    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  59.87 
 
 
333 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  59.87 
 
 
333 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  59.87 
 
 
333 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  60 
 
 
333 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  58.31 
 
 
333 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5443  glycosyl transferase family protein  59.43 
 
 
333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  hitchhiker  0.00908127 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  59.62 
 
 
333 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  59.62 
 
 
333 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  59.62 
 
 
333 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  59.62 
 
 
333 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  59.62 
 
 
333 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  59.62 
 
 
333 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  59.31 
 
 
333 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  56.75 
 
 
344 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  56.75 
 
 
344 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  56.48 
 
 
348 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  45.85 
 
 
323 aa  276  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  47.99 
 
 
328 aa  275  7e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  42.77 
 
 
325 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  38.58 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0716  HAD family hydrolase  43.78 
 
 
501 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.358199  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11260  histidinol-phosphate phosphatase family protein  36.92 
 
 
499 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130521  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1570  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  39.81 
 
 
498 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.892629  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0456  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  39.81 
 
 
499 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
344 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  35.79 
 
 
344 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  36.15 
 
 
322 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
303 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
303 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  36.32 
 
 
322 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
333 aa  95.9  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
298 aa  94  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  29.41 
 
 
283 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
307 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
305 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 
270 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  30.99 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  34.81 
 
 
272 aa  86.7  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
310 aa  85.9  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
455 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 
891 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  22.77 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  37.09 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  29.88 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  31.88 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
477 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  37.31 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
884 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
753 aa  76.3  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1005  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  27.62 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  29.64 
 
 
924 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  26.87 
 
 
754 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  29.57 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.41 
 
 
528 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.58 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
513 aa  70.5  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4199  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  27.31 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4618  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 
785 aa  69.3  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1272  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294715  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3973  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 
525 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0772213  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5475  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  28.95 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.11 
 
 
2401 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  37.62 
 
 
232 aa  67  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
313 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  24.08 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>