More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4329 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  100 
 
 
438 aa  879  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  84.69 
 
 
450 aa  665  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  69.73 
 
 
432 aa  607  1e-172  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  70.22 
 
 
432 aa  606  1e-172  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  69.73 
 
 
432 aa  607  1e-172  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  68.82 
 
 
433 aa  603  1e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  69.95 
 
 
431 aa  601  1e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  70.05 
 
 
429 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  70.05 
 
 
429 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  49.32 
 
 
441 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  50.59 
 
 
424 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  49.53 
 
 
437 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  49.05 
 
 
437 aa  420  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  50.36 
 
 
429 aa  418  1e-115  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  50.36 
 
 
436 aa  417  1e-115  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 
436 aa  417  1e-115  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  49.17 
 
 
436 aa  417  1e-115  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  50.35 
 
 
430 aa  417  1e-115  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  49.43 
 
 
437 aa  415  1e-115  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  48.82 
 
 
437 aa  415  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  48.75 
 
 
441 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  49.64 
 
 
436 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  52.25 
 
 
425 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  47.47 
 
 
437 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  50.48 
 
 
424 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  49.29 
 
 
439 aa  407  1e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  50.24 
 
 
432 aa  399  1e-110  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  49.29 
 
 
436 aa  399  1e-110  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 
419 aa  396  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  49.29 
 
 
441 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  48.13 
 
 
428 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  44.44 
 
 
447 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  47.05 
 
 
438 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  51.87 
 
 
446 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  45.87 
 
 
443 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  46.63 
 
 
447 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  47.13 
 
 
439 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  46.39 
 
 
447 aa  357  2e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  46.17 
 
 
446 aa  356  4e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  45.36 
 
 
444 aa  352  6e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  46.3 
 
 
441 aa  351  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  46.78 
 
 
441 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  47.02 
 
 
441 aa  350  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  45.28 
 
 
417 aa  345  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  44.53 
 
 
430 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  44.53 
 
 
430 aa  340  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  44.53 
 
 
429 aa  340  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  39.9 
 
 
422 aa  334  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  44.44 
 
 
443 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 
443 aa  326  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  46.8 
 
 
428 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  46.24 
 
 
428 aa  322  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  38.4 
 
 
421 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  35.33 
 
 
438 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  2.66277e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  31.7 
 
 
431 aa  229  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  29.22 
 
 
430 aa  159  9e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  30.34 
 
 
411 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
436 aa  147  4e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  28.06 
 
 
402 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 
416 aa  143  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.97 
 
 
402 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 
407 aa  142  1e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  26.72 
 
 
402 aa  141  2e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.21238e-05 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  28.77 
 
 
402 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  29.28 
 
 
412 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 
407 aa  140  4e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  26.25 
 
 
402 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  26.25 
 
 
402 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  26.25 
 
 
402 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  26.25 
 
 
402 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83174e-08 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  26.01 
 
 
402 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  26.25 
 
 
402 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  3.11684e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  29.07 
 
 
380 aa  137  3e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  29.06 
 
 
397 aa  137  3e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 
416 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  28.8 
 
 
412 aa  136  9e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  28.99 
 
 
400 aa  135  2e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  23.88 
 
 
408 aa  135  2e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 
408 aa  135  2e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  28.12 
 
 
400 aa  134  4e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  28.12 
 
 
400 aa  134  4e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  26.83 
 
 
402 aa  134  4e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  26.78 
 
 
400 aa  134  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  27.85 
 
 
400 aa  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  27.85 
 
 
400 aa  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  27.85 
 
 
400 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  29.29 
 
 
400 aa  132  1e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  29.59 
 
 
400 aa  131  2e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  26.58 
 
 
402 aa  131  2e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  26.58 
 
 
402 aa  132  2e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  26.58 
 
 
400 aa  131  2e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  26.58 
 
 
402 aa  131  2e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  26.58 
 
 
402 aa  131  2e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  27.75 
 
 
418 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  26.58 
 
 
402 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  29.29 
 
 
400 aa  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  26.58 
 
 
402 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
415 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  28.26 
 
 
413 aa  130  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 
425 aa  129  8e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>