56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4250 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  100 
 
 		 266 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  52.45 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  43.19 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  43.15 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  43.19 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  42.14 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  43.69 
 
 		 305 aa  178  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  41.25 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  44.98 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  39.8 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  40.69 
 
 		 327 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  39.14 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  41.72 
 
 		 300 aa  168  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  37.36 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  36.59 
 
 		 278 aa  165  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  35.27 
 
 		 264 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.6 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  34.46 
 
 		 265 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  39.79 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  44.09 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  58.4 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  58.4 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  58.4 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  58.4 
 
 		 292 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  58.4 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  58.4 
 
 		 379 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  58.4 
 
 		 379 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  43.93 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  35.06 
 
 		 278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  35.52 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  48.87 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  35.59 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  34.05 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  31.18 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  34.52 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  25.09 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  31.53 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  26.67 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1580  putative transmembrane anti-sigma factor  27.82 
 
 		 271 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1485  putative transmembrane anti-sigma factor  27.82 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0855  putative transmembrane anti-sigma factor  29.59 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366382  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  32.23 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  32.23 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1998  putative transmembrane anti-sigma factor  30.2 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  30.3 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0826  putative transmembrane anti-sigma factor  30.1 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00528212  hitchhiker  0.000460261 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  42.31 
 
 		 363 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2126  putative transmembrane anti-sigma factor  46.3 
 
 		 356 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  29 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0745  putative transmembrane anti-sigma factor  30.61 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5341  putative transmembrane anti-sigma factor  25 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1269  hypothetical protein  37.04 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000022202  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0131  putative transmembrane anti-sigma factor  38.1 
 
 		 347 aa  43.5  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000144677  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  30.83 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2549  putative transmembrane transcriptional regulator  24.47 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  42.31 
 
 		 376 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>