More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4249 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  100 
 
 		 566 aa  1146    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  65.42 
 
 		 566 aa  727    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  44.36 
 
 		 545 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  38.74 
 
 		 550 aa  323  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  46.14 
 
 		 426 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  39.04 
 
 		 557 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  38.39 
 
 		 556 aa  306  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  39.21 
 
 		 568 aa  306  8.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  39.57 
 
 		 568 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  37.9 
 
 		 562 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  36.93 
 
 		 544 aa  302  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  39.67 
 
 		 556 aa  298  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  37.3 
 
 		 559 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  41.06 
 
 		 308 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 		 301 aa  196  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  43.88 
 
 		 297 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  45.42 
 
 		 302 aa  193  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  44.56 
 
 		 311 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  43.4 
 
 		 306 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  40.07 
 
 		 303 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  45.79 
 
 		 303 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 		 278 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  40.49 
 
 		 304 aa  175  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  44.79 
 
 		 313 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  44.13 
 
 		 282 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  44.53 
 
 		 312 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  46.52 
 
 		 303 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  43.17 
 
 		 304 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  39.58 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  41.55 
 
 		 307 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  38.65 
 
 		 302 aa  170  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  42.65 
 
 		 288 aa  170  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 		 316 aa  169  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  43.17 
 
 		 310 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  39.1 
 
 		 302 aa  169  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  41.73 
 
 		 310 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  41.73 
 
 		 310 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  38.27 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  38.27 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  39.72 
 
 		 305 aa  160  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  37.32 
 
 		 307 aa  160  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  40.88 
 
 		 317 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  37.72 
 
 		 310 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  39.34 
 
 		 308 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  37.87 
 
 		 310 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  36.65 
 
 		 310 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  41.18 
 
 		 294 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  40.51 
 
 		 304 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  38.11 
 
 		 315 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  37.37 
 
 		 305 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.79 
 
 		 285 aa  149  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  38.1 
 
 		 301 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  39.06 
 
 		 315 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  39.46 
 
 		 288 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  35.69 
 
 		 273 aa  132  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  31.15 
 
 		 500 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  34.48 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2699  NUDIX hydrolase  42.08 
 
 		 294 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 254 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 272 aa  117  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  37.15 
 
 		 266 aa  117  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  33.59 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  35.2 
 
 		 268 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 		 484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  34.2 
 
 		 264 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  36.02 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.46 
 
 		 259 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  34.83 
 
 		 262 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  32.43 
 
 		 259 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 		 259 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 		 259 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  34.94 
 
 		 260 aa  110  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  38.86 
 
 		 263 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 295 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 		 277 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  36.86 
 
 		 260 aa  108  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 315 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  33.48 
 
 		 309 aa  107  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  31.12 
 
 		 285 aa  107  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  36.32 
 
 		 247 aa  107  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0516  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 264 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  32.4 
 
 		 267 aa  106  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 264 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0330  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 		 259 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478372  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  38.28 
 
 		 497 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 		 263 aa  104  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0641  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.117018  normal  0.604387 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  32.91 
 
 		 262 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 497 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  32.31 
 
 		 267 aa  101  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0328  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 297 aa  101  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121747  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 257 aa  101  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3933  beta-lactamase domain protein  32.83 
 
 		 276 aa  100  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.997989  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3208  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 		 258 aa  100  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.229767  normal  0.168477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 275 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0284  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 296 aa  99.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.144667 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  33.74 
 
 		 257 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 272 aa  99.4  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 285 aa  99  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  30.68 
 
 		 286 aa  98.6  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>