288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4124 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  100 
 
 
299 aa  616  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  37.98 
 
 
276 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  36.58 
 
 
284 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  35.02 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  32.43 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03883  hypothetical protein  42.29 
 
 
216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_003296  RS03884  hypothetical protein  55.34 
 
 
136 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.762573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 
250 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  28.09 
 
 
250 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  27.72 
 
 
250 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  26.42 
 
 
250 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.42 
 
 
250 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  26.42 
 
 
250 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  32.07 
 
 
262 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  26.42 
 
 
250 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  26.42 
 
 
250 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  26.04 
 
 
250 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  33.15 
 
 
198 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 
269 aa  92.8  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 
266 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 
262 aa  90.1  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 
235 aa  89  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  30.04 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  30.63 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  28.98 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  27.92 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  27.87 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  28.34 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  24.51 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  27.78 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2956  beta-lactamase domain-containing protein  24.51 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0379847  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2378  beta-lactamase-like protein  25.52 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3015  hypothetical protein  24.3 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  24.51 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3247  hypothetical protein  24.3 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  24.51 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  27.67 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  28.18 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2721  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.91537  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  32.95 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  22.47 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  27.04 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  24.66 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  26.54 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  26.34 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  26.54 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.91 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  26.29 
 
 
328 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  29.03 
 
 
276 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  26.2 
 
 
292 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  32.69 
 
 
233 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02639  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
365 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.453021 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  30.5 
 
 
270 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  28 
 
 
237 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3485  AHL-lactonase  32.22 
 
 
94 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 
270 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  30.5 
 
 
275 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  24.26 
 
 
297 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1577  hypothetical protein  28.57 
 
 
265 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  26.79 
 
 
300 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0375  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 
271 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2191  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
237 aa  59.7  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  21.35 
 
 
282 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 
327 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  27.33 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  25.76 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  28.46 
 
 
229 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  26.42 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  27.98 
 
 
265 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0033  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 
207 aa  56.6  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.852974  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18590  metallo-beta-lactamase superfamily enzyme  25.24 
 
 
282 aa  56.6  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.344551  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0033  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 
209 aa  56.6  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000234295  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  27.98 
 
 
249 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08635  conserved hypothetical protein  24.76 
 
 
317 aa  56.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.19369 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 
266 aa  56.2  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  25.87 
 
 
294 aa  56.2  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4355  beta-lactamase domain protein  26.06 
 
 
310 aa  55.8  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.112156  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 
327 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 
248 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  34.81 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  29.58 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  23.36 
 
 
308 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002733  GumP protein  25 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 
231 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4421  beta-lactamase domain protein  22.03 
 
 
268 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1316  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 
282 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  25.41 
 
 
327 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>