More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3829 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
388 aa  796    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  88.4 
 
 
389 aa  714    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  95.1 
 
 
388 aa  749    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  88.66 
 
 
388 aa  722    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  88.4 
 
 
389 aa  719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  81.84 
 
 
391 aa  656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  73.26 
 
 
391 aa  590  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  73.97 
 
 
382 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  76.8 
 
 
387 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  71.91 
 
 
390 aa  580  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  71.65 
 
 
382 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  71.91 
 
 
382 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  71.13 
 
 
382 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  71.47 
 
 
385 aa  544  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  68.27 
 
 
395 aa  531  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  59.34 
 
 
383 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  43.7 
 
 
390 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  45.5 
 
 
385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  45.08 
 
 
393 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  45.5 
 
 
383 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  47.13 
 
 
390 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  44.73 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  45.04 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  42.97 
 
 
402 aa  265  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  42.71 
 
 
402 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  41.86 
 
 
383 aa  263  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  42.44 
 
 
403 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  41.99 
 
 
383 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  44.83 
 
 
384 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  41.73 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  42.01 
 
 
380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.75 
 
 
382 aa  253  6e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  40.77 
 
 
385 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  38.68 
 
 
383 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  44.92 
 
 
381 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.88 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  39.79 
 
 
388 aa  242  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  41.43 
 
 
379 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  43.77 
 
 
390 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  41.56 
 
 
384 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  40.7 
 
 
379 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  40.15 
 
 
379 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  43.15 
 
 
382 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  39.64 
 
 
379 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  40.78 
 
 
379 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  43.47 
 
 
384 aa  219  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  39.08 
 
 
380 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  37.84 
 
 
388 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  34.4 
 
 
403 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  35.12 
 
 
402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  35.12 
 
 
402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  35.12 
 
 
402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  35.96 
 
 
388 aa  182  9.000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  41.12 
 
 
389 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  34.63 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.81 
 
 
387 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  33.88 
 
 
390 aa  169  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  33.95 
 
 
381 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  35.73 
 
 
394 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  34.11 
 
 
387 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  33.78 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  32.6 
 
 
388 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  33.5 
 
 
402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.58 
 
 
389 aa  164  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.66 
 
 
388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.66 
 
 
388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.73 
 
 
385 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  33.91 
 
 
390 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  33.25 
 
 
404 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.39 
 
 
388 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.39 
 
 
388 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.39 
 
 
388 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  32.82 
 
 
394 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  33.88 
 
 
389 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  33.76 
 
 
404 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  36.1 
 
 
390 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  33.42 
 
 
396 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  36.6 
 
 
396 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.13 
 
 
388 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  31.81 
 
 
395 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.13 
 
 
388 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.13 
 
 
388 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.66 
 
 
388 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.33 
 
 
385 aa  156  6e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  35.25 
 
 
394 aa  156  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.02 
 
 
388 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  33.15 
 
 
387 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  32.5 
 
 
386 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  32.52 
 
 
397 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  34.53 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  35.55 
 
 
391 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.41 
 
 
397 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  31.49 
 
 
390 aa  153  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  32.01 
 
 
386 aa  153  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  33.33 
 
 
386 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  35.43 
 
 
388 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  35.43 
 
 
388 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  35.43 
 
 
388 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  32.38 
 
 
393 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  29.71 
 
 
394 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>