More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3774 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 177 aa  359  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  45.56 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 189 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 161 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 153 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  39.16 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  41.29 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 148 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 151 aa  94.4  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 143 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 315 aa  94  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 158 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 161 aa  89.4  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 162 aa  88.2  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 162 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 162 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 150 aa  87.8  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 303 aa  84.3  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  39.37 
 
 		 155 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  34.43 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  34.43 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  34.43 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  34.43 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  33.33 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 135 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  37.62 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  33.07 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  30.13 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  39.13 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  29.2 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 167 aa  62  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  29.53 
 
 		 287 aa  60.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  33.61 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.34 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>