More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3711 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  49.52 
 
 		 341 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  45.45 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1598  hypothetical protein  43.09 
 
 		 330 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1191  hypothetical protein  41.5 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0120541  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5287  extra-cytoplasmic solute receptor  42.67 
 
 		 330 aa  258  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.126425 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  43.48 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.88 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  41.08 
 
 		 329 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.82 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.33 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  40.24 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.64 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.03 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  41.06 
 
 		 335 aa  232  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  42.42 
 
 		 325 aa  232  8.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  41.88 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  43.24 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.46 
 
 		 325 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  38.46 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3217  hypothetical protein  39.27 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.16 
 
 		 329 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  39.76 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  39.38 
 
 		 326 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.74 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  40.91 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  39.82 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  40.8 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.01 
 
 		 333 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  40.38 
 
 		 337 aa  222  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.38 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.3 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  38.58 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.39 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  39.26 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  39.73 
 
 		 323 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  39.33 
 
 		 325 aa  219  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  39.69 
 
 		 326 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  38.72 
 
 		 326 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.7 
 
 		 328 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  39 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.76 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  38.67 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.94 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.76 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  39.56 
 
 		 326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  38.79 
 
 		 334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  39.59 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  39.57 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  39.02 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.85 
 
 		 331 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  39.17 
 
 		 326 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.89 
 
 		 327 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  39.08 
 
 		 322 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  40.94 
 
 		 322 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.06 
 
 		 324 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  39.87 
 
 		 320 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.04 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  37.83 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  41.49 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  37.62 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3672  hypothetical protein  37.35 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.423242  normal  0.0951882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  38.71 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  38.51 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  37.74 
 
 		 342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  40.73 
 
 		 328 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  41.67 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  41.03 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  38.85 
 
 		 330 aa  212  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.53 
 
 		 344 aa  212  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  38.85 
 
 		 345 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  37.03 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  40.18 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  36.06 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  40.33 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  37.58 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  37.74 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  38.41 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2870  hypothetical protein  40.87 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  42.14 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  38.89 
 
 		 329 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  36.93 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  42.55 
 
 		 347 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  35.98 
 
 		 333 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  37.9 
 
 		 348 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  38.05 
 
 		 323 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  39.68 
 
 		 331 aa  209  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  37.5 
 
 		 325 aa  208  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  39.41 
 
 		 329 aa  208  9e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.54 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  39.87 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  37.58 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0101  hypothetical protein  36.36 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.344081 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.05 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0118  hypothetical protein  36.21 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  37.66 
 
 		 345 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  37.66 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  39.78 
 
 		 330 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  35.96 
 
 		 324 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2118  hypothetical protein  38.14 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0299117  normal  0.0185863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>