More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3649 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  56.19 
 
 
762 aa  782    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  57.07 
 
 
864 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  53.62 
 
 
769 aa  722    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  54.7 
 
 
765 aa  782    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  57.07 
 
 
864 aa  679    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  59.66 
 
 
793 aa  659    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  57.07 
 
 
864 aa  679    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  55.9 
 
 
789 aa  801    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  56.57 
 
 
755 aa  790    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  100 
 
 
763 aa  1491    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  56.83 
 
 
760 aa  781    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  59.86 
 
 
1079 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  57.47 
 
 
764 aa  800    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  53.9 
 
 
769 aa  729    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  54.94 
 
 
766 aa  751    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  53.95 
 
 
769 aa  730    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  57.23 
 
 
864 aa  681    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  54.92 
 
 
804 aa  770    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  58.43 
 
 
832 aa  683    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  72.04 
 
 
768 aa  1055    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  53.95 
 
 
769 aa  731    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  59.74 
 
 
764 aa  859    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  57.23 
 
 
864 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  55.81 
 
 
767 aa  783    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  53.9 
 
 
769 aa  725    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  58.93 
 
 
769 aa  841    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  53.95 
 
 
769 aa  731    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  57.07 
 
 
864 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 
808 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 
896 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 
896 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  43.49 
 
 
752 aa  538  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
742 aa  378  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
741 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
679 aa  361  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 
679 aa  360  4e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  34.03 
 
 
734 aa  348  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 
762 aa  339  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
772 aa  335  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  35.18 
 
 
878 aa  332  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
740 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
686 aa  325  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  28.8 
 
 
769 aa  312  1e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  29.23 
 
 
769 aa  312  2e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.07 
 
 
1971 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  29.53 
 
 
764 aa  310  6.999999999999999e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
777 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  27.33 
 
 
769 aa  306  9.000000000000001e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
784 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
781 aa  304  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.31 
 
 
1992 aa  301  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  30.37 
 
 
1987 aa  299  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  28.68 
 
 
774 aa  296  8e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
2539 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  28.76 
 
 
770 aa  296  1e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
801 aa  290  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
777 aa  287  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  28.21 
 
 
2336 aa  286  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
756 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
783 aa  284  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
2423 aa  279  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
706 aa  279  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
1629 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
1646 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  29.63 
 
 
770 aa  276  8e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  30.2 
 
 
2301 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
934 aa  276  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
777 aa  275  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
865 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
2212 aa  273  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  30.49 
 
 
785 aa  273  9e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
1758 aa  273  9e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
1647 aa  273  9e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
865 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.47 
 
 
783 aa  271  2.9999999999999997e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  27.94 
 
 
2301 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
758 aa  270  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
1609 aa  267  4e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
1974 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  31.91 
 
 
839 aa  266  8e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 
695 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  27 
 
 
798 aa  266  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  29.57 
 
 
1989 aa  266  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.04 
 
 
1960 aa  265  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
750 aa  264  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
756 aa  264  6e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
753 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
1832 aa  262  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  32.57 
 
 
803 aa  260  6e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 
1065 aa  260  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
705 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.5 
 
 
1956 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
705 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
707 aa  258  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
1725 aa  258  4e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  28.91 
 
 
1834 aa  257  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
1725 aa  257  6e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  28.24 
 
 
764 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 
1907 aa  254  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.16 
 
 
1180 aa  254  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>