More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3642 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 		 496 aa  981    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  85.19 
 
 		 492 aa  800    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  55.01 
 
 		 486 aa  484  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  51.84 
 
 		 503 aa  462  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  48.98 
 
 		 503 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  53.01 
 
 		 521 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  47.94 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  50 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  50.22 
 
 		 482 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  49.12 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  51.66 
 
 		 481 aa  349  6e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  38.14 
 
 		 469 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  38.12 
 
 		 469 aa  306  6e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  37.89 
 
 		 469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  37.89 
 
 		 469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  37.89 
 
 		 469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  37.89 
 
 		 469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  37.89 
 
 		 469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  37.89 
 
 		 469 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  38.06 
 
 		 469 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  38.1 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  38.1 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  37.64 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  37.64 
 
 		 469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  38.27 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  37.73 
 
 		 491 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  36.2 
 
 		 478 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  36.97 
 
 		 480 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  36.55 
 
 		 455 aa  250  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  36.79 
 
 		 476 aa  244  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  35.87 
 
 		 455 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  35.87 
 
 		 455 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  37.24 
 
 		 436 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 449 aa  224  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  32.51 
 
 		 449 aa  223  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  34.31 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  32.49 
 
 		 458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  31.24 
 
 		 448 aa  213  7e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  30.42 
 
 		 485 aa  205  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  30.69 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 500 aa  193  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  29.96 
 
 		 500 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  28.66 
 
 		 499 aa  186  6e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.67 
 
 		 481 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 500 aa  177  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.63 
 
 		 525 aa  176  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 454 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 538 aa  173  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 518 aa  170  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 443 aa  167  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  29 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  29.17 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 453 aa  163  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 485 aa  162  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 554 aa  160  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  36.25 
 
 		 270 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 490 aa  156  8e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  30.14 
 
 		 442 aa  152  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  29.7 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  30.67 
 
 		 500 aa  150  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  38.5 
 
 		 238 aa  150  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 446 aa  147  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 461 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.62 
 
 		 460 aa  143  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.13 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 448 aa  141  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  27.4 
 
 		 477 aa  139  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  27.81 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.16 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.39 
 
 		 462 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 451 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.77 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 445 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 456 aa  131  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  23.43 
 
 		 475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  27.29 
 
 		 463 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  24.27 
 
 		 505 aa  127  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 469 aa  126  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 458 aa  126  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  30.27 
 
 		 442 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 475 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.51 
 
 		 475 aa  123  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  23.4 
 
 		 461 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 468 aa  123  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>