More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3608 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
291 aa  591  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  83.1 
 
 
289 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  74.91 
 
 
294 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  67.89 
 
 
301 aa  391  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  64.14 
 
 
296 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  63.03 
 
 
290 aa  364  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  64.48 
 
 
296 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  62.5 
 
 
296 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  62.67 
 
 
309 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  55.88 
 
 
307 aa  333  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.81 
 
 
297 aa  328  9e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  59.66 
 
 
295 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2021  enoyl-CoA hydratase  61.94 
 
 
299 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  61.46 
 
 
293 aa  319  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.3 
 
 
282 aa  319  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  56.74 
 
 
298 aa  288  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  50.54 
 
 
291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1856  enoyl-CoA hydratase  51.57 
 
 
288 aa  256  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  47.55 
 
 
288 aa  246  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3638  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.48 
 
 
293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  46.64 
 
 
292 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48 
 
 
290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  46.49 
 
 
285 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  46.49 
 
 
285 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  46.49 
 
 
285 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 
274 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00370  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01890)  42.11 
 
 
291 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.526484  normal  0.612902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.78 
 
 
269 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.27 
 
 
271 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  39.48 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.96 
 
 
271 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 
279 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 
270 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  38.03 
 
 
276 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
275 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 
271 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  34.06 
 
 
270 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  38.72 
 
 
281 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  38.72 
 
 
281 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  35.85 
 
 
282 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 
275 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 
268 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  39.71 
 
 
265 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.49 
 
 
281 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
270 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  36.98 
 
 
263 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  38.2 
 
 
270 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
270 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  35.58 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 
275 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.53 
 
 
264 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.18 
 
 
267 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  37.97 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  38.7 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  37.23 
 
 
267 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 
262 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  37.97 
 
 
272 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  36.7 
 
 
264 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
257 aa  142  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.79 
 
 
263 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  34.59 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.95 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
259 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  36.67 
 
 
264 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.86 
 
 
260 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 
258 aa  139  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  37.17 
 
 
262 aa  139  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
260 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
267 aa  138  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
261 aa  138  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 
260 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 
258 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 
262 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.35 
 
 
257 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.5 
 
 
256 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
264 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
260 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
259 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
273 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
260 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.05 
 
 
260 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  34.44 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  34.91 
 
 
264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
264 aa  135  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
261 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.56 
 
 
264 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
269 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  36.67 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>