112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3597 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
254 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.16 
 
 
155 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  30.83 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.51 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.87 
 
 
216 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.94 
 
 
147 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  26.4 
 
 
1027 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.19 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.57 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  25.41 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.17 
 
 
148 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.55 
 
 
154 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 
151 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.67 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.6 
 
 
202 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  28.24 
 
 
161 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.06 
 
 
158 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4415  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.43 
 
 
150 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  31.01 
 
 
176 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.67 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.99 
 
 
178 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.86 
 
 
157 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  28.24 
 
 
208 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.23 
 
 
176 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.89 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.26 
 
 
154 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.38 
 
 
198 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.92 
 
 
154 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.4 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.57 
 
 
153 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 
224 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  28.89 
 
 
206 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.76 
 
 
150 aa  58.9  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.68 
 
 
197 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.47 
 
 
147 aa  58.9  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.29 
 
 
1011 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  29.1 
 
 
150 aa  58.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  25.68 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  29.1 
 
 
150 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.81 
 
 
193 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.08 
 
 
151 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.29 
 
 
1011 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  27.96 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.85 
 
 
469 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  30.25 
 
 
1012 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  28.78 
 
 
1012 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.28 
 
 
204 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.08 
 
 
151 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.7 
 
 
212 aa  56.2  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.17 
 
 
182 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  29.41 
 
 
980 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  24.29 
 
 
289 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24 
 
 
295 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  23.33 
 
 
997 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.19 
 
 
152 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.67 
 
 
182 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.98 
 
 
148 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.46 
 
 
149 aa  53.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3140  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.5 
 
 
182 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0169757  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.69 
 
 
152 aa  52.4  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4550  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.96 
 
 
227 aa  52  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.36 
 
 
151 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2340  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00233273  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.17 
 
 
225 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.29 
 
 
155 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.76 
 
 
187 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  27.73 
 
 
1019 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  23.03 
 
 
200 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  25.17 
 
 
262 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.56 
 
 
222 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.56 
 
 
222 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.56 
 
 
222 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3792  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding:carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.68 
 
 
390 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.78 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5312  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.32 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.19 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.76 
 
 
181 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.36 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  20 
 
 
983 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.86 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.28 
 
 
269 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2945  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.19 
 
 
182 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0435616  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.88 
 
 
249 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6937  transposase IS3/IS911 family protein  28.21 
 
 
127 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  52.94 
 
 
128 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  52.94 
 
 
128 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.41 
 
 
158 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.41 
 
 
158 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.58 
 
 
154 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.83 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.78 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3913  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.81 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0164888  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.33 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.33 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  23.19 
 
 
991 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
112 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
112 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
112 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
112 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>