More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3580 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  76.11 
 
 		 467 aa  685    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  71.43 
 
 		 467 aa  683    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  944    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  76.11 
 
 		 467 aa  685    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  70.52 
 
 		 467 aa  671    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  72.31 
 
 		 479 aa  688    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  69.96 
 
 		 468 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  70.07 
 
 		 468 aa  622  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  70.07 
 
 		 468 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  70.07 
 
 		 468 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  70.07 
 
 		 474 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  70.14 
 
 		 468 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  70.07 
 
 		 468 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  70.07 
 
 		 474 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4557  major facilitator transporter  67.1 
 
 		 466 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783301 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4092  major facilitator transporter  66.88 
 
 		 466 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5602  major facilitator transporter  68.16 
 
 		 466 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.610871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1116  major facilitator transporter  66.23 
 
 		 466 aa  601  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.10577  normal  0.134 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4698  major facilitator transporter  68.16 
 
 		 466 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.585046  normal  0.168682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3669  major facilitator transporter  68.16 
 
 		 466 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3995  major facilitator transporter  67.53 
 
 		 466 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0613817 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  40.08 
 
 		 480 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 480 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  39.88 
 
 		 480 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 480 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  39.88 
 
 		 480 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0632  general substrate transporter  40.49 
 
 		 471 aa  333  4e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000142658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  39.13 
 
 		 459 aa  323  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5071  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 		 485 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.706796  normal  0.279172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  38.03 
 
 		 460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 		 461 aa  306  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  41.7 
 
 		 434 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 455 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 451 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 447 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 474 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 474 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  33.63 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  34.44 
 
 		 476 aa  196  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  33.48 
 
 		 455 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 474 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  32.97 
 
 		 459 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 		 472 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 473 aa  193  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 451 aa  192  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.76 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  33.48 
 
 		 467 aa  187  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 459 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 447 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  33.48 
 
 		 478 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  33.48 
 
 		 478 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  33.7 
 
 		 478 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  33.48 
 
 		 478 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  33.7 
 
 		 478 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  33.48 
 
 		 478 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 462 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  33.7 
 
 		 478 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 466 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.87 
 
 		 468 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  29.69 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.89 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 473 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 446 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 465 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.08 
 
 		 470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.85 
 
 		 468 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  29.65 
 
 		 464 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 456 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 454 aa  160  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 451 aa  159  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 514 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 450 aa  158  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 459 aa  158  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 454 aa  156  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.82 
 
 		 450 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  29.05 
 
 		 399 aa  156  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  29 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  29.05 
 
 		 399 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0708  4-hydroxybenzoate transporter, putative  33.72 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0289026  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 399 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0717  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 530 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320017 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2604  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.792684  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>