More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3548 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  670    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  89.55 
 
 		 366 aa  587  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  55.06 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  52.86 
 
 		 330 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  49.33 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  45.83 
 
 		 327 aa  309  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  44.64 
 
 		 326 aa  298  7e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  47.67 
 
 		 334 aa  291  9e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  42.53 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  42.53 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  45.25 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  42.39 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  44.65 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  46.08 
 
 		 325 aa  268  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  45.22 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.18 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.3 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  45.45 
 
 		 341 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.39 
 
 		 328 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.42 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.16 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.09 
 
 		 328 aa  259  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  42.62 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.76 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  42.12 
 
 		 356 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.74 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.76 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  43.17 
 
 		 327 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.62 
 
 		 327 aa  255  9e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  43.61 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  44.74 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  39.94 
 
 		 329 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.89 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  40.24 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  45.3 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.11 
 
 		 339 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  42.57 
 
 		 323 aa  252  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  43.62 
 
 		 330 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  43.24 
 
 		 330 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.49 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  41.34 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  44.74 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.96 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  42.21 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  43.29 
 
 		 322 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5494  extra-cytoplasmic solute receptor  42.48 
 
 		 329 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.01 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  41.25 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.58 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  43.14 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.78 
 
 		 358 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.76 
 
 		 330 aa  249  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  41.95 
 
 		 328 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  41.47 
 
 		 323 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.2 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  42.14 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  44.04 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  42.86 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  40.97 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.11 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  39.18 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.99 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.95 
 
 		 328 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1866  hypothetical protein  43.54 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  42.3 
 
 		 322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  41.38 
 
 		 330 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  42.76 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  41.38 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.81 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  39.81 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  44.63 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.69 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.1 
 
 		 335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.59 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  42.53 
 
 		 335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.1 
 
 		 331 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  41.39 
 
 		 325 aa  242  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  41.32 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  44.48 
 
 		 322 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  39.51 
 
 		 331 aa  242  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.77 
 
 		 314 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  39.6 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.61 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.39 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.13 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.61 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.87 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  42.49 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  40.44 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.3 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  40.6 
 
 		 353 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  40.12 
 
 		 336 aa  239  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  41.49 
 
 		 324 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  38.49 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  40.07 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  42.52 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3875  hypothetical protein  42.48 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.229403  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.75 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  43.96 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>