More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3509 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3509  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
276 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3895  putative transcriptional regulator  77.42 
 
 
249 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.221719  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5518  transcriptional regulator, GntR family  35.74 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0560672  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1119  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
257 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2038  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.335666 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.86 
 
 
243 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 
243 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
243 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4635  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195845  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1691  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
276 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0269955  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  35.21 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  24.3 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 
245 aa  77  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  27.39 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  32.89 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  32.89 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1438  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  28.46 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  32.89 
 
 
245 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  44.58 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  32.89 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0342  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0407848  hitchhiker  0.000377769 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  26.96 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  26.96 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.96 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.96 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5049  histidine utilization repressor  28.38 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00586645  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 
246 aa  72  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 
249 aa  72  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
240 aa  72  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  26.52 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  28.39 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.96 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  38.82 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  31.13 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0724  transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4702  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.99 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  26.42 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1300  histidine utilization repressor  30.7 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  25.57 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  26.67 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00724  histidine utilization repressor  27.94 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.42 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  26.42 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0853  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.122159  hitchhiker  0.00270002 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  26.42 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0505  histidine utilization repressor  40 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  26.42 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  21.97 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  25.31 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  26.42 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  26.42 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000268297  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  36.46 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  30.46 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2358  histidine utilization repressor  30.42 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0081  histidine utilization repressor  25.34 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  35.42 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  23.14 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  29.07 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  35.42 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00713  transcription regulator protein  28.57 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000339699  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>