52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_AR0001 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_AR0001  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0002  tRNA-Cys  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04005  tRNA-Cys  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000662406  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0036  tRNA-Cys  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0038  tRNA-Cys  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0112511  hitchhiker  0.000384671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2286  hypothetical protein  91.8 
 
 		 462 bp  81.8  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00240664  hitchhiker  0.00043215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0026  tRNA-Cys  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.285214  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0038  tRNA-Cys  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.206737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0028  tRNA-Cys  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt35  tRNA-Cys  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt35  tRNA-Cys  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0001  tRNA-Cys  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0012  tRNA-Cys  88.71 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0384692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0009  tRNA-Cys  88.71 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705692  normal  0.0935108 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0925  tRNA-Cys  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1032  tRNA-Cys  89.66 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0021  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0033  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0041  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.283149  normal  0.794533 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0007  tRNA-Cys  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305224  normal  0.390037 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0005  tRNA-Cys  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.627398 
 
 
-
 
NC_003295  RS04829  tRNA-Cys  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0856  tRNA-Cys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.569143  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0037  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0501912  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0018  tRNA-Cys  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0022  tRNA-Cys  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0031  tRNA-Cys  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000180821  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0034  tRNA-Cys  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.786637  normal  0.65843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60570  tRNA-Cys  85.96 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109168  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0036  tRNA-Cys  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0579773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14033  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000415175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0019  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0046  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0953188  normal  0.971333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0025  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0007  tRNA-Cys  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0046  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0015  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0055  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0015  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0022  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.230202  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0016  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0855316  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0037  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348473  normal  0.348376 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0038  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.292986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0030  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0038  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0038  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0035978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0048  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0059965  normal  0.349002 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0036  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.423302  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0045  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.34247  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0039  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00215479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0035  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0071  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>