186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3443 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  100 
 
 
282 aa  567  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  76.07 
 
 
286 aa  441  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  58.78 
 
 
274 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  59.85 
 
 
274 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  57.93 
 
 
276 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  57.93 
 
 
276 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  57.93 
 
 
276 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  57.93 
 
 
276 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  57.93 
 
 
276 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  57.93 
 
 
276 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  57.93 
 
 
276 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  57.93 
 
 
276 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  57.4 
 
 
276 aa  318  9e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  58.43 
 
 
277 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  58.43 
 
 
277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  58.04 
 
 
277 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  57.65 
 
 
277 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  50.9 
 
 
274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  50.54 
 
 
274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  50.54 
 
 
274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  56.86 
 
 
277 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  56.47 
 
 
277 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  49.82 
 
 
274 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  49.82 
 
 
274 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  56.47 
 
 
277 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  49.82 
 
 
274 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  53.05 
 
 
274 aa  296  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  54.9 
 
 
274 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  54.51 
 
 
274 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  49.82 
 
 
290 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  49.82 
 
 
290 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  49.82 
 
 
290 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  49.82 
 
 
290 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  52.29 
 
 
274 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  49.12 
 
 
290 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  51.53 
 
 
274 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  45.88 
 
 
308 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  45.88 
 
 
306 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  39.42 
 
 
241 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  38.32 
 
 
241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  35.69 
 
 
241 aa  161  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  38.04 
 
 
241 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1003  hypothetical protein  34.27 
 
 
277 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  36.76 
 
 
240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  37.46 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  37.46 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1731  OmpW family outer membrane protein  34.72 
 
 
498 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0288  putative lipoprotein  34.72 
 
 
498 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0277  putative lipoprotein  34.72 
 
 
498 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.561631  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1815  OmpW family outer membrane protein  34.72 
 
 
498 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1319  putative lipoprotein  34.72 
 
 
498 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.598416  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  37.1 
 
 
243 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  37.97 
 
 
241 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  37.45 
 
 
243 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  37.45 
 
 
243 aa  148  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  37.97 
 
 
241 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  37.97 
 
 
241 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  37.45 
 
 
243 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  37.45 
 
 
243 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  37.45 
 
 
243 aa  148  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  37.45 
 
 
243 aa  148  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  37.45 
 
 
243 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  36.04 
 
 
243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  36.04 
 
 
243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4176  OmpW  35.27 
 
 
464 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.504746  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4190  OmpW family protein  35.27 
 
 
464 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3327  OmpW family protein  35.27 
 
 
464 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  37.11 
 
 
243 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  36.75 
 
 
243 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1141  putative lipoprotein  35.07 
 
 
504 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.917542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  37.1 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  36.22 
 
 
239 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  35.83 
 
 
239 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  34.28 
 
 
241 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1835  OmpW family protein  34.93 
 
 
463 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.306199  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  34.33 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2401  putative outer membrane protein  29.17 
 
 
371 aa  125  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  32.05 
 
 
246 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  32.69 
 
 
246 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  27.13 
 
 
382 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  29.74 
 
 
245 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  29.66 
 
 
248 aa  95.5  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  29.7 
 
 
217 aa  87  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  27.8 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  25.99 
 
 
213 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  24.28 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  24.3 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  23.44 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  23.05 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  23.66 
 
 
213 aa  62.4  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  24.26 
 
 
211 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  24.26 
 
 
211 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  25.71 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  19.9 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  24.63 
 
 
211 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  26.19 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  22.1 
 
 
224 aa  58.9  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  24.76 
 
 
212 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  22.69 
 
 
210 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  24.76 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>