115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3420 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2799  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  67.7 
 
 		 616 aa  871    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0083  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.32 
 
 		 599 aa  699    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3385  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.78 
 
 		 618 aa  862    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0017  phosphoenolpyruvate carboxykinase  84.73 
 
 		 622 aa  1115    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.982063  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  80.66 
 
 		 621 aa  1057    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0665  phosphoenolpyruvate carboxykinase  72.77 
 
 		 614 aa  926    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0083  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.31 
 
 		 604 aa  776    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3420  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 		 618 aa  1283    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1574  phosphoenolpyruvate carboxykinase  80.66 
 
 		 621 aa  1057    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347763  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0386  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  58.27 
 
 		 619 aa  726    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1511  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.74 
 
 		 621 aa  1016    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.717731 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0023  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.13 
 
 		 621 aa  849    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.162015 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2012  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.07 
 
 		 630 aa  865    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2638  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.4 
 
 		 617 aa  861    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000194383  normal  0.814307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3419  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.94 
 
 		 620 aa  846    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407575  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2808  phosphoenolpyruvate carboxykinase  80.43 
 
 		 621 aa  1048    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0495385  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3676  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.43 
 
 		 596 aa  669    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3897  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.27 
 
 		 609 aa  789    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0160  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.85 
 
 		 622 aa  1007    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000637249  normal  0.985404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4422  phosphoenolpyruvate carboxykinase  83.28 
 
 		 618 aa  1088    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0707425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3577  phosphoenolpyruvate carboxykinase  93.18 
 
 		 618 aa  1214    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0537  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.16 
 
 		 584 aa  814    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.584132  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3922  phosphoenolpyruvate carboxykinase  79.14 
 
 		 621 aa  1025    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0176  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.83 
 
 		 609 aa  727    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.62 
 
 		 621 aa  1022    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309168  normal  0.0994612 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0667  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.05 
 
 		 611 aa  709    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  79.14 
 
 		 621 aa  1025    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0901  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.21 
 
 		 616 aa  793    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0051  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.77 
 
 		 621 aa  859    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4211  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  65.42 
 
 		 614 aa  819    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16117  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0190  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.54 
 
 		 614 aa  669    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2479  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  59.27 
 
 		 597 aa  726    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.215275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0731  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  58.44 
 
 		 611 aa  741    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0185  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.83 
 
 		 609 aa  727    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0201  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.15 
 
 		 609 aa  751    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0138  phosphoenolpyruvate carboxykinase  76.25 
 
 		 620 aa  1002    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0102  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.85 
 
 		 622 aa  1007    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.999469  normal  0.0413186 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0078  phosphoenolpyruvate carboxykinase  74.44 
 
 		 623 aa  977    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1250  phosphoenolpyruvate carboxykinase  80.66 
 
 		 621 aa  1057    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1673  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.2 
 
 		 592 aa  772    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136297  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3705  phosphoenolpyruvate carboxykinase  76.84 
 
 		 625 aa  1017    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.442706 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0620  phosphoenolpyruvate carboxykinase  80.66 
 
 		 621 aa  1057    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.755794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.53 
 
 		 605 aa  775    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00158332  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1446  phosphoenolpyruvate carboxykinase  80.66 
 
 		 621 aa  1057    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1475  phosphoenolpyruvate carboxykinase  80.66 
 
 		 621 aa  1057    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0165  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.83 
 
 		 609 aa  727    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0533  phosphoenolpyruvate carboxykinase  80.66 
 
 		 616 aa  1056    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0451  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.84 
 
 		 609 aa  741    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2083  phosphoenolpyruvate carboxykinase  73.1 
 
 		 621 aa  967    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.581009  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0861  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.13 
 
 		 612 aa  749    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.473448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8530  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  59.39 
 
 		 614 aa  751    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741618  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0870  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.72 
 
 		 617 aa  851    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00431316  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5171  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.44 
 
 		 606 aa  791    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0325265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2496  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.78 
 
 		 619 aa  843    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10213  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.2 
 
 		 606 aa  728    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.116836  normal  0.471876 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3537  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.48 
 
 		 625 aa  700    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310577  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3803  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.43 
 
 		 595 aa  674    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0268368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2846  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.11 
 
 		 619 aa  846    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0833  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.89 
 
 		 607 aa  776    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.961355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0621  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  66.07 
 
 		 632 aa  855    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.655459  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06760  phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  55.41 
 
 		 646 aa  693    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.46 
 
 		 612 aa  752    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042459 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4876  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  58.19 
 
 		 604 aa  730    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0429  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.83 
 
 		 609 aa  848    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0114  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75 
 
 		 621 aa  984    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4179  phosphoenolpyruvate carboxykinase  79.77 
 
 		 621 aa  1027    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5861  phosphoenolpyruvate carboxykinase  79.3 
 
 		 621 aa  1026    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0061457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3945  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.05 
 
 		 624 aa  1003    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  72.61 
 
 		 621 aa  961    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.401418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4337  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.62 
 
 		 621 aa  1021    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0718  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.33 
 
 		 608 aa  815    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0030  phosphoenolpyruvate carboxykinase  81.98 
 
 		 618 aa  1079    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1210  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.66 
 
 		 608 aa  767    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0304  phosphoenolpyruvate carboxykinase  81.98 
 
 		 618 aa  1077    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3739  phosphoenolpyruvate carboxykinase  85.37 
 
 		 622 aa  1119    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0031  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.49 
 
 		 621 aa  870    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3462  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.55 
 
 		 616 aa  869    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00146202  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0033  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.28 
 
 		 619 aa  845    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00652728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0052  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.44 
 
 		 622 aa  874    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0050  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.84 
 
 		 617 aa  853    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465134  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3734  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.09 
 
 		 596 aa  665    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0734  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.72 
 
 		 647 aa  836    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1092  phosphoenolpyruvate carboxykinase  74.66 
 
 		 615 aa  942    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.28153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3060  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.55 
 
 		 611 aa  874    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0814  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.56 
 
 		 616 aa  697    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3817  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.09 
 
 		 596 aa  666    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.799264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0212  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.97 
 
 		 597 aa  733    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0812521  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0097  phosphoenolpyruvate carboxykinase  74.44 
 
 		 623 aa  977    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0393  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.31 
 
 		 588 aa  667    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3601  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.74 
 
 		 655 aa  664    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  79.16 
 
 		 620 aa  1044    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262073  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03380  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.45 
 
 		 614 aa  686    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3416  phosphoenolpyruvate carboxykinase  84.89 
 
 		 622 aa  1117    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0749  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.72 
 
 		 647 aa  837    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6994  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.7 
 
 		 603 aa  696    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0693  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.03 
 
 		 598 aa  666    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0734  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.72 
 
 		 617 aa  805    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39080  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.83 
 
 		 608 aa  721    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.377396  normal  0.557231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5314  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.81 
 
 		 647 aa  705    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4475  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  60.67 
 
 		 608 aa  770    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.475526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>