More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3418 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  100 
 
 		 481 aa  959    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  83.58 
 
 		 475 aa  795    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  61.41 
 
 		 488 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.95 
 
 		 488 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  61.94 
 
 		 487 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  59.24 
 
 		 456 aa  521  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.44 
 
 		 471 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.87 
 
 		 486 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  53.32 
 
 		 466 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  53.32 
 
 		 466 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  53.32 
 
 		 466 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  53.1 
 
 		 466 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  53.1 
 
 		 466 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.91 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.49 
 
 		 461 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  53.1 
 
 		 466 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  52.83 
 
 		 470 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.17 
 
 		 459 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  53.1 
 
 		 466 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.83 
 
 		 459 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  51.96 
 
 		 460 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.96 
 
 		 480 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.74 
 
 		 459 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.96 
 
 		 480 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.38 
 
 		 469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  53.88 
 
 		 456 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.06 
 
 		 477 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.51 
 
 		 478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  50.53 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  52.87 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  48.38 
 
 		 470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  49.02 
 
 		 458 aa  405  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.56 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 		 485 aa  345  8e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  40.83 
 
 		 461 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  42.13 
 
 		 459 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  42.22 
 
 		 451 aa  325  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  40.13 
 
 		 451 aa  322  6e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 447 aa  317  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  36.5 
 
 		 483 aa  312  9e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 		 474 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 480 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  39.41 
 
 		 456 aa  299  7e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 464 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  33.92 
 
 		 469 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  33.04 
 
 		 467 aa  276  9e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  41.94 
 
 		 287 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  36.02 
 
 		 564 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  36.96 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  38.36 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.63 
 
 		 564 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 1229 aa  130  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  35.78 
 
 		 1101 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  36.09 
 
 		 482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 1226 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 535 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 357 aa  127  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  30.94 
 
 		 585 aa  127  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  37.91 
 
 		 557 aa  126  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6528  histidine kinase  36.02 
 
 		 592 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  32.4 
 
 		 392 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 775 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  39.01 
 
 		 772 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 695 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  39.86 
 
 		 373 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  31.37 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  31.84 
 
 		 357 aa  124  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 662 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  37.55 
 
 		 799 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 554 aa  123  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  33.45 
 
 		 643 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  37.39 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  35.19 
 
 		 683 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 658 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  36.99 
 
 		 662 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  27.05 
 
 		 553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  27.3 
 
 		 553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  39.38 
 
 		 640 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  37 
 
 		 497 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4910  histidine kinase  35.38 
 
 		 347 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00236658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1608  histidine kinase  34.62 
 
 		 565 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 468 aa  120  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 640 aa  120  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  36.4 
 
 		 797 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 770 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 359 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 312 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  35.59 
 
 		 680 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 801 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  35.14 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  35.77 
 
 		 619 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  33.48 
 
 		 249 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 490 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 		 563 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  35.77 
 
 		 680 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 596 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  34.36 
 
 		 461 aa  116  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 595 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>