More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3413 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
303 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3570  LysR family transcriptional regulator  87.04 
 
 
310 aa  540  1e-152  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  68.37 
 
 
312 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  68.03 
 
 
312 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3684  transcriptional regulator, LysR family  67.35 
 
 
312 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  48.46 
 
 
351 aa  275  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 
351 aa  274  1e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 
351 aa  274  1e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 
351 aa  274  1e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 
351 aa  274  1e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 
351 aa  274  1e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  48.11 
 
 
351 aa  274  1e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 
351 aa  274  1e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  48.97 
 
 
367 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 
367 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 
362 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
349 aa  268  6e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
349 aa  268  6e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
349 aa  268  6e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
349 aa  268  6e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3186  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
349 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3069  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
349 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
349 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1971  LysR family transcriptional regulator  48.49 
 
 
355 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  48.83 
 
 
353 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01980  LysR family transcriptional regulator  43.19 
 
 
312 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.445097 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  42.27 
 
 
299 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.81 
 
 
299 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  42.19 
 
 
355 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  43.45 
 
 
299 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1864  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
331 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708451  normal  0.0358907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 
322 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
313 aa  220  2e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
313 aa  220  2e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
313 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
313 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
313 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2586  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 
295 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2712  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
295 aa  218  8e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4797  transcriptional regulator, LysR family  41.72 
 
 
331 aa  218  9e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0282773  hitchhiker  7.20419e-06 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2690  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 
295 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 
312 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2661  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
295 aa  216  3e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.583907  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2050  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
295 aa  216  3e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
306 aa  215  6e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 
312 aa  215  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 
300 aa  215  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5787  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 
308 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05458  transcription regulator protein  41.87 
 
 
298 aa  215  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
313 aa  214  1e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4290  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
308 aa  213  2e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3498  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
298 aa  214  2e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00180927  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 
312 aa  213  3e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  40.82 
 
 
313 aa  213  3e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 
313 aa  213  4e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
297 aa  213  5e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 
293 aa  212  5e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 
301 aa  212  6e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
313 aa  211  8e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  40.48 
 
 
313 aa  211  8e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
313 aa  211  8e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
313 aa  211  8e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  40.48 
 
 
313 aa  211  8e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
313 aa  211  8e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  41.89 
 
 
298 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
313 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
304 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3230  regulatory protein, LysR  38.23 
 
 
298 aa  210  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.796191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  40.91 
 
 
323 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 
311 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1112  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
336 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
336 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
336 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
336 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2329  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
354 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1646  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
354 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
298 aa  208  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1025  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
336 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951762  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4285  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
315 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.300927 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 
335 aa  208  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2617  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 
301 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000166311  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  38.54 
 
 
305 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3585  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
312 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364205  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1681  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
315 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446962  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2375  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 
301 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00507322  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
301 aa  203  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 
298 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0807  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
310 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4214  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
315 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.383155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0523  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
310 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 
305 aa  202  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3740  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
315 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3196  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
315 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3510  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
317 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
318 aa  202  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1262  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
315 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.902208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4461  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
315 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0521  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
317 aa  201  1e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4325  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
315 aa  201  1e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0522  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
317 aa  201  1e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>