More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3399 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3399  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 221 aa  434  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  43.75 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0028  lysine exporter protein LysE/YggA  41.83 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.214928 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.83 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.743196  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  41.04 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0048  lysine exporter protein LysE/YggA  42.79 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  39.02 
 
 		 205 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  38.03 
 
 		 255 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  40.1 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  38.54 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  35.96 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  40.89 
 
 		 203 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.16 
 
 		 209 aa  132  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180103 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0065  lysine exporter protein LysE/YggA  40.57 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.969114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 		 204 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  41.95 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  34.45 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2176  leucine export protein LeuE  31.8 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  34.45 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  32.24 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  31.78 
 
 		 224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1324  leucine export protein LeuE  32.81 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.81 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  35.21 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  35.21 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  35.21 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  35.21 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  31.31 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.35 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  31.71 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1412  leucine export protein LeuE  32.71 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.250602 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  31.71 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  32.55 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.21 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  37.9 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  35.21 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  32.35 
 
 		 212 aa  105  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  30.43 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  30.43 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.58 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  32.71 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  30.77 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  30.43 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  30.43 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  30.58 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  33.17 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  32.85 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  30.43 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  33.17 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  30.58 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  33.17 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1371  leucine export protein LeuE  34.26 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655348  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  32.55 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  32.69 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  28.64 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  33.52 
 
 		 219 aa  102  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  32.35 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  32.35 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  32.35 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  32.35 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  30.19 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  32.35 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1914  leucine export protein LeuE  33.49 
 
 		 216 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  34.43 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  34.43 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.03 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  34.43 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  34.43 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  34.43 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  34.43 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  34.43 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  32.7 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  28.17 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  31.88 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  31.88 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  31.31 
 
 		 214 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  31.88 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  31.88 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  35.21 
 
 		 211 aa  98.2  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1180  leucine export protein LeuE  31.6 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  31.88 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  32.21 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.84 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  30.62 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  30.24 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  32.38 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  29.95 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  31.4 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  29.27 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  29.3 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  32.58 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  30.92 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  30.7 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  30.43 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  33.96 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  30.92 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  34.1 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>