248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3395 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  100 
 
 		 301 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  79.07 
 
 		 304 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  59.86 
 
 		 294 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  60.07 
 
 		 298 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0570  hypothetical protein  60.76 
 
 		 298 aa  305  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  60.42 
 
 		 298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2949  transporter DMT superfamily protein  57.29 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0891  transporter DMT superfamily protein  54.76 
 
 		 292 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  51.19 
 
 		 335 aa  276  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  54.51 
 
 		 302 aa  276  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4018  rarD protein  55.86 
 
 		 316 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  51.59 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  54.09 
 
 		 297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  45.36 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  41.84 
 
 		 305 aa  238  9e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  43.55 
 
 		 305 aa  235  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  43.46 
 
 		 315 aa  232  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.84 
 
 		 302 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  43.66 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  41.22 
 
 		 300 aa  228  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.29 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  42.41 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.77 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  40.61 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  43 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.6 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  41.9 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  42.76 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  42.96 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  42.37 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  43 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  43 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  43 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  44.76 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.62 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  43 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  43 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  43 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  42.61 
 
 		 295 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  42.32 
 
 		 294 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  42.32 
 
 		 294 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  44.44 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  42.76 
 
 		 295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.6 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.6 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  41.98 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.32 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  40.73 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  42.32 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.25 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  42.32 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  42.45 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  40.73 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  40.73 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  40.73 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  40.73 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  40.67 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  43.06 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.76 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  43.57 
 
 		 302 aa  216  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  40.73 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  40.73 
 
 		 313 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  40.4 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  40.73 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  39.93 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  39.74 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  42.76 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  41.72 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  42.14 
 
 		 293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  42.41 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  42.41 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  42.41 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  42.41 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  39.65 
 
 		 318 aa  212  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  42.27 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  38.59 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  42.47 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6667  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.98 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605512  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1476  hypothetical protein  41.44 
 
 		 307 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.52 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.2 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0466  transporter DMT superfamily protein  46.93 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  41.81 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  44.44 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  41.81 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  41.81 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.79 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  42.36 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.13 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5070  RarD protein, DMT superfamily transporter  41.28 
 
 		 351 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.62 
 
 		 333 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  42.86 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  42.86 
 
 		 295 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0535  transporter DMT superfamily protein  41.69 
 
 		 493 aa  205  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.595832  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.62 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3677  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.83 
 
 		 320 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1110  transporter DMT superfamily protein  43.07 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2608  transporter DMT superfamily protein  42.81 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1859  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.17 
 
 		 310 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23910  rarD protein  39.51 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00670263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>