35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3224 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  100 
 
 		 212 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  62.67 
 
 		 230 aa  263  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  46.09 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  45.92 
 
 		 247 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  42.73 
 
 		 240 aa  174  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  34.18 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  28.05 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  30.07 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4494  putative general secretory pathway protein J  26.54 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.13576 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  26.49 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  26.49 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  26.49 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  26.49 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  26.49 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3511  general secretory pathway protein J  26.49 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  26.49 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  26.49 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  24.5 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  23.38 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  23.38 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  22.93 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  23.38 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  28 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  44.44 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  37.74 
 
 		 291 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  31.67 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  27.08 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  25.76 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  30.7 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  30.7 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  31.43 
 
 		 282 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  27.87 
 
 		 227 aa  42  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0015  putative general secretion pathway protein J  21.13 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  24.79 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0055  general secretion pathway protein  21.13 
 
 		 232 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>