More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2958 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
103 aa  208  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  98.06 
 
 
103 aa  203  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  90.29 
 
 
103 aa  190  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  90.29 
 
 
103 aa  190  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  90.29 
 
 
103 aa  190  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  88.35 
 
 
103 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  88.35 
 
 
103 aa  185  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  88.35 
 
 
103 aa  185  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  87.38 
 
 
103 aa  183  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  87.38 
 
 
103 aa  183  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  87.38 
 
 
103 aa  183  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  87.38 
 
 
103 aa  183  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  87.38 
 
 
103 aa  183  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  87.38 
 
 
103 aa  183  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  87.38 
 
 
103 aa  183  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  86.41 
 
 
103 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  86.41 
 
 
103 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  86.41 
 
 
103 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  86.41 
 
 
103 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  86.41 
 
 
103 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  86.41 
 
 
103 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  86.41 
 
 
103 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  81.55 
 
 
103 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  76.7 
 
 
103 aa  174  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  78.64 
 
 
103 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  77.67 
 
 
103 aa  169  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  76.47 
 
 
103 aa  169  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  80.2 
 
 
103 aa  169  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  80.2 
 
 
103 aa  168  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  77.67 
 
 
103 aa  167  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  75.73 
 
 
103 aa  166  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  76.24 
 
 
103 aa  166  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  74.76 
 
 
103 aa  165  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  74.76 
 
 
103 aa  163  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  76.24 
 
 
103 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  76.24 
 
 
103 aa  160  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  69.9 
 
 
103 aa  157  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  71.29 
 
 
131 aa  156  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  65.05 
 
 
103 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  66.02 
 
 
104 aa  144  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 
103 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 
103 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  61.17 
 
 
103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 
103 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 
103 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 
103 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1119  50S ribosomal protein L21  60.4 
 
 
105 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
104 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
104 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
104 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
104 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 
103 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  57.28 
 
 
103 aa  122  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 
103 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 
103 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 
103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  55.88 
 
 
102 aa  118  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  53.4 
 
 
103 aa  118  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  55.34 
 
 
103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
115 aa  117  6e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 
103 aa  117  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
115 aa  116  9e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  53.47 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  114  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  114  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
104 aa  114  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  114  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
104 aa  114  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
103 aa  114  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
103 aa  114  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  51.46 
 
 
103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  54.81 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  50.96 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  110  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  110  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  110  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  110  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  54.46 
 
 
103 aa  110  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>