More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2878 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  57.4 
 
 		 792 aa  776    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 707 aa  1457    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  76.26 
 
 		 694 aa  1071    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  75 
 
 		 715 aa  1077    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  50.14 
 
 		 719 aa  635  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  49.4 
 
 		 710 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  48.66 
 
 		 770 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  48.66 
 
 		 710 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  46.19 
 
 		 706 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  46.19 
 
 		 706 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  45.51 
 
 		 695 aa  568  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  43.96 
 
 		 709 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  43.96 
 
 		 757 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  35.99 
 
 		 727 aa  369  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 700 aa  355  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  35.08 
 
 		 755 aa  352  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 689 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  33.42 
 
 		 742 aa  349  8e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  33.42 
 
 		 742 aa  349  8e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  32.73 
 
 		 753 aa  340  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 		 698 aa  340  8e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 689 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  31.74 
 
 		 732 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 745 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 		 719 aa  328  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  34.86 
 
 		 724 aa  324  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 732 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  35.05 
 
 		 705 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  34.43 
 
 		 724 aa  320  5e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 751 aa  316  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4395  TonB-dependent siderophore receptor  34.16 
 
 		 756 aa  308  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 771 aa  307  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  29.9 
 
 		 734 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 		 821 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  33.47 
 
 		 755 aa  299  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 734 aa  296  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  32.83 
 
 		 712 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4786  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 		 712 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.789588  normal  0.608467 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 		 736 aa  293  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  30.74 
 
 		 769 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 766 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  32.68 
 
 		 680 aa  291  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  32.42 
 
 		 749 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 		 734 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 		 707 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 741 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  31.94 
 
 		 753 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 		 656 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  29.91 
 
 		 703 aa  283  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 		 860 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 735 aa  280  5e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  31.98 
 
 		 731 aa  278  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 		 732 aa  276  8e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  31.8 
 
 		 714 aa  276  8e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  29.3 
 
 		 708 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 850 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  31.83 
 
 		 733 aa  272  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 		 740 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 736 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 720 aa  270  7e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 		 743 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 709 aa  269  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 732 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  32.07 
 
 		 765 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 825 aa  268  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 696 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  32.07 
 
 		 817 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.3 
 
 		 696 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 		 864 aa  264  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 733 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 825 aa  263  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 		 726 aa  263  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  30.22 
 
 		 747 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001067  ferric siderophore receptor PsuA  31.68 
 
 		 678 aa  261  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2558  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 760 aa  260  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.897783  normal  0.0361628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 701 aa  260  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  30.79 
 
 		 726 aa  259  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  28.75 
 
 		 862 aa  259  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 703 aa  259  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 		 843 aa  258  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 815 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3085  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 767 aa  258  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  0.216415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.25 
 
 		 703 aa  256  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 737 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3526  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 722 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 777 aa  253  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 689 aa  251  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1569  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 767 aa  250  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.428413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 692 aa  250  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 738 aa  250  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 759 aa  249  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 759 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 753 aa  248  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 		 741 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 701 aa  247  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 730 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 724 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 730 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 689 aa  244  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 779 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>