More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2706 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  80.97 
 
 		 249 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  67.97 
 
 		 250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  58.06 
 
 		 250 aa  292  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  59.92 
 
 		 251 aa  290  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  57.66 
 
 		 250 aa  289  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  57.66 
 
 		 250 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  57.26 
 
 		 250 aa  287  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  58.87 
 
 		 250 aa  279  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  55.1 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  55.1 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  55.1 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  55.1 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  54.69 
 
 		 252 aa  268  8e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  54.69 
 
 		 252 aa  268  8e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  54.69 
 
 		 252 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  56.97 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  54.29 
 
 		 252 aa  265  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  54.69 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  54.69 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  59.15 
 
 		 252 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  59.83 
 
 		 251 aa  261  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  59.66 
 
 		 253 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  59.27 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  59.23 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  58.37 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  53.36 
 
 		 253 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  53.36 
 
 		 253 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  53.36 
 
 		 253 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  53.36 
 
 		 253 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  52.94 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  58.37 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  52.7 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  52.7 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  52.7 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  52.7 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  52.7 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  52.7 
 
 		 262 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  56.09 
 
 		 252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  52.28 
 
 		 254 aa  245  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  52.74 
 
 		 254 aa  245  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  55.76 
 
 		 235 aa  243  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  55.79 
 
 		 253 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  55.79 
 
 		 253 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  56.65 
 
 		 604 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  55.65 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  57.89 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  55.7 
 
 		 254 aa  228  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  44.35 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  44.5 
 
 		 275 aa  168  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  39.06 
 
 		 312 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  42.79 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  40.76 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  39.42 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  30.99 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  25.88 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  30.23 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  29.3 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  32.91 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  31.85 
 
 		 311 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  29.52 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  24.9 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  31.85 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  32.34 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  29.78 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  28.85 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  28.08 
 
 		 288 aa  72  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  28.44 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  31.97 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  33.76 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  29.46 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  32.12 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  29.11 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  29.17 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  31.14 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  28.09 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  30.32 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2649  putative Zn-dependent protease  33.76 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157554  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  25.85 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  28.85 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  25.33 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  28.22 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  29.58 
 
 		 266 aa  67  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1773  putative metalloprotease  31.74 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.480116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  28.24 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  30.87 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  29.05 
 
 		 529 aa  67  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0890  peptidase M48, Ste24p  32.52 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397549  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  28.09 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  35.03 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  31.4 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  28.46 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  27.17 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0153  peptidase M48, Ste24p  28.76 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0497682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  26.38 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  31.28 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  27.03 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  28.46 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  30.81 
 
 		 479 aa  65.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  25.94 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>