88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2653 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  100 
 
 		 148 aa  296  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  71.14 
 
 		 148 aa  218  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  53.29 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  45.77 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  42.54 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  39.86 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  41.06 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  38.57 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  40.71 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  40.71 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  40.71 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  40.56 
 
 		 153 aa  94.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  41.22 
 
 		 153 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  41.22 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  41.22 
 
 		 153 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  40 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  36.42 
 
 		 152 aa  90.1  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2017  TadE family protein  34.87 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  58.82 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  33.59 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  35.29 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  37.35 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  28.47 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  28.76 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  28.76 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  28.76 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  25.15 
 
 		 176 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  32.73 
 
 		 177 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  27.85 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  27.85 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  33.33 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  45.1 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  34.78 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  48.94 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  30.86 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  46 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  34.48 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  42.31 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  42.31 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  47.83 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  46 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  46 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  46 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  46 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  46 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  46 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  42.31 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  35.87 
 
 		 722 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  40.38 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  48.98 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  35.87 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  31.86 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  46.67 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  46 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  35.34 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  48 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  41.18 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  33.33 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  51.11 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  35.56 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  40.74 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  42.31 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  37.04 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  45.83 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  45.83 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  38.18 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  48.89 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  46.51 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  39.34 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  28.08 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  25.17 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  43.75 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5124  TadE family protein  39.62 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0349202 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1838  TadE family protein  44.9 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2404  TadE family protein  30.3 
 
 		 138 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0489166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  38.78 
 
 		 177 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  39.22 
 
 		 140 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  28.41 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  48.98 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2734  TadE family protein  30 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  42.55 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0612  TadE family protein  28.23 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  40.82 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1910  TadE-like  30.3 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236029  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  32.26 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  38.46 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  25.76 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  32.14 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>