81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2621 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  100 
 
 		 182 aa  360  9e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  74.18 
 
 		 180 aa  268  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  58.66 
 
 		 181 aa  200  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  58.1 
 
 		 181 aa  197  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  56.91 
 
 		 181 aa  184  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  41.32 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  35.29 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  35.91 
 
 		 176 aa  104  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  32.74 
 
 		 170 aa  104  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  30.73 
 
 		 176 aa  92  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  33.71 
 
 		 175 aa  85.9  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  33.15 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  32.53 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  32.73 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  32.53 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  35.93 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  30.9 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3188  twitching motility signal transduction protein  35.03 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.572564  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  28.24 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2550  CheW protein  27.88 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  26.53 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  31.47 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  31.03 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  28.78 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  29.93 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  30.61 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  25.32 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  28.87 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  28.87 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  30.07 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  26.21 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  29.79 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  27.96 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  25 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  24.09 
 
 		 136 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  32.35 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  27.66 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  27.66 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  30.85 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3334  CheW protein  36.99 
 
 		 136 aa  47.8  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  30.85 
 
 		 176 aa  47.8  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  33.33 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  24.44 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  25 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  27.46 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2398  CheW protein  33.71 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.773649 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  26.21 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  22.5 
 
 		 141 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  32.71 
 
 		 137 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  22.61 
 
 		 139 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  25.19 
 
 		 163 aa  44.3  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  23.4 
 
 		 478 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  25 
 
 		 568 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  30.68 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  29.01 
 
 		 533 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  24.07 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  30.97 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  28.69 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  30.97 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  24.78 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  28.85 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  26.47 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  23.23 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0722  CheW protein  27.27 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  33.33 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  25 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  28.65 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  24.77 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  28.93 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.36 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  22.52 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  27.46 
 
 		 162 aa  42  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  27.46 
 
 		 157 aa  42  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  27 
 
 		 164 aa  42  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  22.88 
 
 		 178 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  20.27 
 
 		 165 aa  42  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  24.79 
 
 		 163 aa  42  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  23.81 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  22.52 
 
 		 164 aa  41.2  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  22.76 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  22.73 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>