More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2450 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  69.32 
 
 		 531 aa  724    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 		 553 aa  1087    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  70.37 
 
 		 549 aa  739    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  69.89 
 
 		 539 aa  708    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  58.67 
 
 		 534 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  57.59 
 
 		 539 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  58.56 
 
 		 541 aa  603  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  54.09 
 
 		 536 aa  530  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  52.79 
 
 		 518 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  50.64 
 
 		 522 aa  458  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  48.05 
 
 		 562 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  48.07 
 
 		 555 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  47.69 
 
 		 539 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  44.04 
 
 		 585 aa  356  5e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  44.62 
 
 		 510 aa  343  5.999999999999999e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  41.61 
 
 		 564 aa  310  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  39.79 
 
 		 592 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  39.58 
 
 		 571 aa  272  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  48.99 
 
 		 290 aa  240  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  35.01 
 
 		 506 aa  232  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  49.83 
 
 		 308 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  56.44 
 
 		 203 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  30.45 
 
 		 549 aa  225  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  47.45 
 
 		 312 aa  224  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  34.5 
 
 		 499 aa  219  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  49.67 
 
 		 293 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  48.29 
 
 		 286 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  56.65 
 
 		 203 aa  211  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  48.62 
 
 		 311 aa  209  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  52.48 
 
 		 204 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  49.81 
 
 		 312 aa  204  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  42.86 
 
 		 288 aa  203  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  48.81 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  53.61 
 
 		 204 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  45.95 
 
 		 292 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  45.95 
 
 		 292 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  45.95 
 
 		 292 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  43.88 
 
 		 285 aa  196  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  47.95 
 
 		 285 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  48.64 
 
 		 288 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  48.51 
 
 		 201 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  50.25 
 
 		 205 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  50.75 
 
 		 203 aa  187  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  42.02 
 
 		 325 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  44.37 
 
 		 288 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  47.52 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  42.16 
 
 		 298 aa  181  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  40.2 
 
 		 300 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  44.29 
 
 		 282 aa  177  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  44.64 
 
 		 248 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  41.97 
 
 		 314 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  47.29 
 
 		 235 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  47.47 
 
 		 221 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  47.47 
 
 		 221 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  47.47 
 
 		 221 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  47.72 
 
 		 233 aa  167  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  45.77 
 
 		 212 aa  166  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  45.73 
 
 		 200 aa  161  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  47.5 
 
 		 203 aa  161  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  38.91 
 
 		 323 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  47.94 
 
 		 209 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  37.79 
 
 		 353 aa  159  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  33.99 
 
 		 319 aa  157  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  31.19 
 
 		 329 aa  156  8e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  37.42 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  36.01 
 
 		 349 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  36.04 
 
 		 348 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  37.34 
 
 		 354 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  32.01 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  32.24 
 
 		 343 aa  151  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  42.52 
 
 		 229 aa  150  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  33.77 
 
 		 307 aa  149  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  35.51 
 
 		 350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  45.54 
 
 		 234 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  35.8 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2381  urea amidolyase related protein  38.17 
 
 		 325 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  36.71 
 
 		 354 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  38.02 
 
 		 345 aa  146  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  35.2 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  36.43 
 
 		 301 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  36.27 
 
 		 310 aa  145  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  35.05 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1268  Allophanate hydrolase subunit 1  41.86 
 
 		 219 aa  145  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  39.59 
 
 		 344 aa  144  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1495  urea amidolyase related protein  39.18 
 
 		 344 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0419081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  41.15 
 
 		 230 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  41.26 
 
 		 246 aa  144  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3875  urea amidolyase related protein  36.39 
 
 		 305 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  30.3 
 
 		 306 aa  143  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  42.41 
 
 		 242 aa  143  8e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  34.37 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  36.45 
 
 		 309 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0097  allophanate hydrolase subunit 1  40.61 
 
 		 258 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  33.44 
 
 		 328 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  34.29 
 
 		 310 aa  141  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  34.46 
 
 		 309 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  34.98 
 
 		 365 aa  140  4.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  45.73 
 
 		 222 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  31.53 
 
 		 322 aa  140  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  45.29 
 
 		 217 aa  140  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>