More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2439 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2439  porin  100 
 
 		 359 aa  729    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  71.47 
 
 		 361 aa  528  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  59.64 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  60 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  59.04 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  60 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  59.52 
 
 		 351 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  51.19 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  51.19 
 
 		 387 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  51.04 
 
 		 358 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  51.19 
 
 		 358 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  51.75 
 
 		 361 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  48.2 
 
 		 367 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  50 
 
 		 358 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  50.15 
 
 		 358 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  50.15 
 
 		 358 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  50.15 
 
 		 358 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  51.18 
 
 		 361 aa  298  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  49.26 
 
 		 358 aa  295  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  49.41 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  49.7 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  46.04 
 
 		 357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  45.75 
 
 		 357 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  44.69 
 
 		 365 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  42.57 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  41.14 
 
 		 344 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  40.29 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  41.24 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  39.78 
 
 		 344 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  47.65 
 
 		 332 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  43.15 
 
 		 340 aa  233  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  43.62 
 
 		 341 aa  229  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  41.54 
 
 		 342 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  39.43 
 
 		 362 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  37.15 
 
 		 357 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  37.15 
 
 		 357 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  36.69 
 
 		 357 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  37.76 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  37.76 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  34.52 
 
 		 340 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  32.69 
 
 		 341 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  35.77 
 
 		 344 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  32.56 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  34.96 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  35.65 
 
 		 362 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  36.96 
 
 		 351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  33.69 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  30.03 
 
 		 389 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  30.03 
 
 		 389 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  29.87 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  32.53 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  34.9 
 
 		 374 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  32.64 
 
 		 430 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  32.64 
 
 		 430 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  32.64 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  32.64 
 
 		 411 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  33.33 
 
 		 352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  32.64 
 
 		 384 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  32.64 
 
 		 384 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  32.64 
 
 		 384 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  28.25 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  30.51 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  32.4 
 
 		 368 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  31.72 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  32.97 
 
 		 386 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  30.85 
 
 		 523 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  31.78 
 
 		 385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  30.23 
 
 		 359 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  35.05 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  32.69 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  30.97 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  30.98 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  32.04 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  32.04 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  31.18 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  30.23 
 
 		 359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  30.23 
 
 		 359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  30.51 
 
 		 359 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  31.01 
 
 		 385 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  31.67 
 
 		 390 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  31.84 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  31.78 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4632  porin Gram-negative type  29.08 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.656997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  33.9 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  29.97 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  33.9 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  31.5 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  37.74 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  30.7 
 
 		 496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.1 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  37.74 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  30.64 
 
 		 383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  33.88 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  31.64 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  31.93 
 
 		 426 aa  110  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  28.45 
 
 		 359 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  31 
 
 		 392 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  31 
 
 		 392 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  33.62 
 
 		 383 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  30.13 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>