164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2431 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  100 
 
 		 206 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  84.06 
 
 		 241 aa  315  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  74.24 
 
 		 204 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  76.97 
 
 		 190 aa  272  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  76.4 
 
 		 190 aa  271  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  64.43 
 
 		 203 aa  255  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  67.72 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  61.29 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  67.2 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  67.2 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  67.2 
 
 		 218 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  67.2 
 
 		 190 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  66.67 
 
 		 190 aa  248  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  67.55 
 
 		 204 aa  244  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  63.68 
 
 		 190 aa  240  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  64.74 
 
 		 191 aa  238  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  66.67 
 
 		 190 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  66.67 
 
 		 190 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  66.67 
 
 		 190 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  66.67 
 
 		 190 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  66.67 
 
 		 190 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  66.67 
 
 		 190 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  66.67 
 
 		 190 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  66.84 
 
 		 192 aa  237  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  64.02 
 
 		 190 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  65.08 
 
 		 190 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  66.31 
 
 		 192 aa  235  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  64.71 
 
 		 192 aa  235  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  62.96 
 
 		 190 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  66.31 
 
 		 187 aa  231  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  63.3 
 
 		 188 aa  229  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  61.26 
 
 		 188 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  65.26 
 
 		 191 aa  226  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  61.45 
 
 		 187 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  58.51 
 
 		 193 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  61.05 
 
 		 196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  59.14 
 
 		 196 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  53.48 
 
 		 185 aa  204  9e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  53.48 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  54.26 
 
 		 191 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  51.37 
 
 		 184 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  51.37 
 
 		 184 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  53.16 
 
 		 188 aa  181  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  52.94 
 
 		 191 aa  181  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  53.01 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  48.17 
 
 		 200 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  50.54 
 
 		 189 aa  177  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  52.13 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  51.6 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  50 
 
 		 195 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  51.06 
 
 		 194 aa  171  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  50.53 
 
 		 194 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  49.46 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  54.45 
 
 		 190 aa  170  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  51.06 
 
 		 194 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  49.73 
 
 		 184 aa  167  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  49.73 
 
 		 184 aa  167  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  49.73 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  49.73 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  48.66 
 
 		 184 aa  165  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3666  hypothetical protein  54.07 
 
 		 194 aa  164  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  48.66 
 
 		 184 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  50.53 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  52.49 
 
 		 185 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  50.53 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  45.23 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  48.45 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  48.97 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  47.31 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  47.94 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  48.13 
 
 		 188 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  48.66 
 
 		 184 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3880  hypothetical protein  46.07 
 
 		 188 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000226161  hitchhiker  0.000000250469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  47.42 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  47.03 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  47.59 
 
 		 186 aa  152  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0914  hypothetical protein  49.73 
 
 		 184 aa  151  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  42.63 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61260  hypothetical protein  53.49 
 
 		 192 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  44.39 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0682  hypothetical protein  48.13 
 
 		 184 aa  147  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  47.54 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  42.47 
 
 		 194 aa  144  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5275  hypothetical protein  54.22 
 
 		 192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.932867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41250  hypothetical protein  51.45 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396742  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  46.49 
 
 		 187 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  36.32 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  35.26 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1664  protein of unknown function UPF0016  38.25 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  36.84 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  37.76 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  33.68 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  35.26 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  35.64 
 
 		 189 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  36.75 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  36.36 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  33.68 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  34.74 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  34.55 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  34.9 
 
 		 194 aa  95.5  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>