More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2365 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  100 
 
 		 404 aa  832    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  64.39 
 
 		 404 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  63.8 
 
 		 438 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  64.65 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  64.65 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  63.54 
 
 		 404 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  63.13 
 
 		 404 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  58.82 
 
 		 391 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  51.77 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  51.26 
 
 		 401 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  49.1 
 
 		 404 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  44.62 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  49.1 
 
 		 402 aa  348  8e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  45.04 
 
 		 417 aa  346  5e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  44.1 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  44.1 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  43.96 
 
 		 402 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  44.44 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  44.07 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2383  integrase family protein  49.1 
 
 		 427 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  42.75 
 
 		 420 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  43.85 
 
 		 389 aa  334  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  42.2 
 
 		 404 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  42.71 
 
 		 404 aa  332  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  41.94 
 
 		 404 aa  332  7.000000000000001e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  44.25 
 
 		 421 aa  332  7.000000000000001e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  43.64 
 
 		 391 aa  332  8e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  43.04 
 
 		 387 aa  332  8e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  44.39 
 
 		 396 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  44.81 
 
 		 406 aa  331  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  43.39 
 
 		 403 aa  332  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  43.64 
 
 		 409 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  44.5 
 
 		 401 aa  329  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  42.31 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  44.78 
 
 		 413 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  43.85 
 
 		 395 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  43.22 
 
 		 402 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  43.33 
 
 		 396 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  42.56 
 
 		 404 aa  322  6e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  42.56 
 
 		 404 aa  322  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  42.56 
 
 		 404 aa  322  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  44.61 
 
 		 419 aa  322  8e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  44.5 
 
 		 394 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  42.86 
 
 		 394 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  42.35 
 
 		 394 aa  319  6e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  44.58 
 
 		 406 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  43.32 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  39.19 
 
 		 404 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  41.71 
 
 		 401 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  42.14 
 
 		 412 aa  315  6e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  44.72 
 
 		 445 aa  315  9e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  40.78 
 
 		 396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  43.47 
 
 		 405 aa  312  9e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  39.69 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  40.88 
 
 		 410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  43.86 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  43.29 
 
 		 404 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  42.96 
 
 		 407 aa  308  9e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  41.16 
 
 		 421 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  42.96 
 
 		 404 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  40.55 
 
 		 408 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  41.49 
 
 		 412 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  41.06 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  40.56 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  43 
 
 		 420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  43.87 
 
 		 419 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  43.63 
 
 		 419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  40.4 
 
 		 403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  40.15 
 
 		 395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  43.43 
 
 		 397 aa  303  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  42.4 
 
 		 418 aa  303  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  42.79 
 
 		 420 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  39.49 
 
 		 422 aa  301  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  42.79 
 
 		 421 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  41.16 
 
 		 419 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  40.94 
 
 		 409 aa  300  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  44.1 
 
 		 402 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  41.18 
 
 		 419 aa  300  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  39.85 
 
 		 419 aa  300  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  42.25 
 
 		 411 aa  299  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  39.21 
 
 		 402 aa  299  7e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  44.28 
 
 		 425 aa  298  8e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  39.85 
 
 		 418 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  42.16 
 
 		 418 aa  297  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  39.49 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  40.87 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  41.2 
 
 		 422 aa  296  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  42.25 
 
 		 402 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  42.54 
 
 		 421 aa  296  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  39.59 
 
 		 409 aa  296  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  38.85 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  37.22 
 
 		 410 aa  296  6e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  42.07 
 
 		 413 aa  296  6e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  41.5 
 
 		 419 aa  295  7e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  43 
 
 		 415 aa  295  8e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  41.52 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  39.13 
 
 		 449 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  38.6 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  41.03 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  39.49 
 
 		 415 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>