More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2296 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  100 
 
 		 289 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  82.35 
 
 		 285 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  76.68 
 
 		 275 aa  374  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  76.77 
 
 		 275 aa  371  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  74.02 
 
 		 275 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  78.16 
 
 		 273 aa  362  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  73.62 
 
 		 278 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  81.97 
 
 		 273 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  76.98 
 
 		 274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  72.83 
 
 		 278 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  72.83 
 
 		 278 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  72.83 
 
 		 278 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  72.83 
 
 		 278 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  72.83 
 
 		 278 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  72.83 
 
 		 278 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  72.83 
 
 		 278 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  70.8 
 
 		 277 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  68.42 
 
 		 277 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  68.09 
 
 		 279 aa  346  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  69.71 
 
 		 277 aa  346  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  72.83 
 
 		 277 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  72.83 
 
 		 277 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  72.83 
 
 		 277 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  60.08 
 
 		 262 aa  315  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  60.24 
 
 		 263 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  56.92 
 
 		 263 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  57.87 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  54.12 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  52.4 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  54.62 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  54.9 
 
 		 261 aa  251  8.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  51.18 
 
 		 262 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  48.56 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  49.63 
 
 		 271 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  50.19 
 
 		 280 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  52.36 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  50 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  49.46 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  47.77 
 
 		 258 aa  242  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  47.74 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  47.74 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  56.15 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  51.6 
 
 		 274 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  52.28 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  50 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  50 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  44.94 
 
 		 254 aa  210  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  48.35 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  40.56 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  36.58 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  36.19 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  36.19 
 
 		 255 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  37.8 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  36.07 
 
 		 263 aa  162  7e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  34.92 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  36.61 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  40.87 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  36.69 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  35.02 
 
 		 270 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  34.88 
 
 		 268 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  36.48 
 
 		 263 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  37.67 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 276 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  34.12 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  31.66 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  33.17 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  31.09 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  32.19 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  34.23 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  28.69 
 
 		 251 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  29.24 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  31.58 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.72 
 
 		 622 aa  94.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 266 aa  92.8  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  29 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.47 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  30.21 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.53 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  31.37 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  29.87 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.5 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  32.12 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6150  putative ABC-2 type transporter (permease protein)  25 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00809538  normal  0.0938496 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2741  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  24.46 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  24.46 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.27 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0495  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>