107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2268 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2268  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  403  1e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2433  hypothetical protein  75.61 
 
 
205 aa  255  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0977  protein of unknown function DUF177  53.89 
 
 
178 aa  188  6e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1047  hypothetical protein  47.67 
 
 
179 aa  174  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.785486  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0912  protein of unknown function DUF177  51.3 
 
 
178 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802583  normal  0.107154 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2186  hypothetical protein  45.63 
 
 
211 aa  144  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.903442  normal  0.111774 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4230  hypothetical protein  46.83 
 
 
211 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879956  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1076  hypothetical protein  45.85 
 
 
211 aa  139  2e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.824913 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0998  hypothetical protein  46.34 
 
 
211 aa  138  5e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0994  hypothetical protein  46.34 
 
 
211 aa  138  5e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1118  hypothetical protein  45.37 
 
 
211 aa  134  7e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0638  hypothetical protein  45.37 
 
 
211 aa  133  2e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469855  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1069  hypothetical protein  44.22 
 
 
217 aa  131  8e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959716  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1806  hypothetical protein  43.37 
 
 
210 aa  130  1e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2856  hypothetical protein  43.37 
 
 
210 aa  130  1e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2483  hypothetical protein  43.37 
 
 
210 aa  130  1e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.168161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2799  hypothetical protein  43.37 
 
 
210 aa  130  1e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.268577  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0527  hypothetical protein  43.37 
 
 
210 aa  130  1e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2795  hypothetical protein  43.37 
 
 
210 aa  130  1e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553189  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2910  hypothetical protein  43.37 
 
 
210 aa  130  1e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0825  hypothetical protein  45.55 
 
 
212 aa  127  8e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2915  protein of unknown function DUF177  43.37 
 
 
214 aa  127  9e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1714  hypothetical protein  43.88 
 
 
210 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0395  hypothetical protein  37.31 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.822595  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0402  protein of unknown function DUF177  33.66 
 
 
191 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1180  hypothetical protein  33.85 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2636  protein of unknown function DUF177  32.99 
 
 
183 aa  84  1e-15  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3283  hypothetical protein  32.49 
 
 
183 aa  83.6  2e-15  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3079  hypothetical protein  30.46 
 
 
184 aa  81.3  8e-15  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1510  hypothetical protein  31.79 
 
 
174 aa  73.2  2e-12  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0199831  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3263  hypothetical protein  29.23 
 
 
184 aa  73.6  2e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3653  hypothetical protein  32.79 
 
 
168 aa  72.8  3e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25620  hypothetical protein  30.81 
 
 
178 aa  72  6e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00500507  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0614  hypothetical protein  32.99 
 
 
190 aa  70.5  2e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2190  hypothetical protein  30.81 
 
 
178 aa  70.5  2e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1727  hypothetical protein  31.55 
 
 
182 aa  70.1  2e-11  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2037  hypothetical protein  32.35 
 
 
174 aa  62.4  4e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.25431e-07  normal  0.0155007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2012  hypothetical protein  29.1 
 
 
187 aa  61.2  1e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2629  hypothetical protein  31.43 
 
 
174 aa  59.7  3e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.83088e-08  hitchhiker  1.64508e-06 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2431  protein of unknown function DUF177  30.73 
 
 
174 aa  59.7  3e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0999209  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1985  hypothetical protein  34.56 
 
 
174 aa  58.5  6e-08  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  4.6877e-07  decreased coverage  0.000655562 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1598  hypothetical protein  32.86 
 
 
174 aa  58.2  9e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.26789e-08  hitchhiker  0.000998263 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0513  hypothetical protein  34.65 
 
 
197 aa  57.8  1e-07  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223212  hitchhiker  0.00953865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1386  protein of unknown function DUF177  37.16 
 
 
185 aa  57.8  1e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1238  hypothetical protein  35 
 
 
170 aa  57.8  1e-07  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509174  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1901  hypothetical protein  36.36 
 
 
173 aa  57  2e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  8.44005e-11  hitchhiker  6.03572e-06 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1604  protein of unknown function DUF177  30.29 
 
 
173 aa  56.6  2e-07  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141183  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1210  hypothetical protein  35.65 
 
 
173 aa  56.2  3e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.84281e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2039  hypothetical protein  35.65 
 
 
173 aa  56.2  3e-07  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.23338e-10  hitchhiker  3.03245e-05 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01092  hypothetical protein  35.65 
 
 
173 aa  56.2  3e-07  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  2.03492e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01084  hypothetical protein  35.65 
 
 
173 aa  56.2  3e-07  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.18944e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2513  hypothetical protein  35.65 
 
 
173 aa  55.8  4e-07  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  9.85112e-09  hitchhiker  6.61717e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2236  hypothetical protein  35.65 
 
 
173 aa  55.8  4e-07  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.70485e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1069  hypothetical protein  32.45 
 
 
166 aa  55.8  4e-07  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429486  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1210  hypothetical protein  35.65 
 
 
173 aa  55.8  4e-07  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.98054e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14880  hypothetical protein  34.96 
 
 
175 aa  55.5  5e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2236  hypothetical protein  35.59 
 
 
173 aa  55.5  5e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0449788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1582  hypothetical protein  35.66 
 
 
173 aa  55.8  5e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000319504  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1494  hypothetical protein  30.43 
 
 
174 aa  54.7  8e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  9.69755e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2499  hypothetical protein  30.15 
 
 
174 aa  55.1  8e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.06501e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1624  hypothetical protein  36.61 
 
 
175 aa  54.7  1e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.752967 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1603  hypothetical protein  35.65 
 
 
173 aa  53.9  1e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  1.20656e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1289  hypothetical protein  34.78 
 
 
173 aa  53.5  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0001847  hitchhiker  2.30682e-13 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0867  protein of unknown function DUF177  32.26 
 
 
169 aa  53.5  2e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1304  hypothetical protein  34.78 
 
 
173 aa  53.5  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0170278  hitchhiker  5.2483e-10 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2563  hypothetical protein  30.43 
 
 
174 aa  53.5  2e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  5.29312e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1260  hypothetical protein  34.78 
 
 
173 aa  53.5  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  2.96903e-06  normal  0.293656 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0454  hypothetical protein  30.37 
 
 
215 aa  53.9  2e-06  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.180134  normal  0.312368 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1996  hypothetical protein  34.78 
 
 
173 aa  53.5  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  8.50849e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2179  hypothetical protein  34.78 
 
 
173 aa  53.5  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  1.45299e-05  hitchhiker  1.56783e-12 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2559  protein of unknown function DUF177  34.78 
 
 
173 aa  53.1  3e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.87302e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3504  hypothetical protein  35.59 
 
 
174 aa  53.1  3e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.22055e-08  hitchhiker  0.00648337 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1681  hypothetical protein  35.59 
 
 
174 aa  53.1  3e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.42559e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1573  hypothetical protein  35.59 
 
 
174 aa  53.1  3e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.25555e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1577  hypothetical protein  29.71 
 
 
174 aa  52.4  5e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  2.16707e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2127  hypothetical protein  28.12 
 
 
175 aa  52.4  5e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1618  hypothetical protein  34.96 
 
 
173 aa  52  6e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  8.31476e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0518  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  51.6  7e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.993145  hitchhiker  0.00918152 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2508  hypothetical protein  37.29 
 
 
173 aa  51.6  7e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  2.57627e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2006  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  51.6  7e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2401  hypothetical protein  29.71 
 
 
174 aa  51.6  8e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.62111e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2471  hypothetical protein  29.71 
 
 
174 aa  51.6  8e-06  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.59273e-07  hitchhiker  0.00620906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1714  hypothetical protein  29.71 
 
 
174 aa  51.2  1e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.35289e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0707  hypothetical protein  32 
 
 
180 aa  50.8  1e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.041241  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2781  hypothetical protein  30.15 
 
 
174 aa  51.2  1e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1754  hypothetical protein  29.71 
 
 
174 aa  51.2  1e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.80096e-08  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1711  hypothetical protein  30.71 
 
 
174 aa  50.4  2e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.54481e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1554  hypothetical protein  32.52 
 
 
139 aa  50.4  2e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.576052  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1426  hypothetical protein  30.33 
 
 
181 aa  50.4  2e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120339  normal  0.649251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2653  hypothetical protein  30.71 
 
 
174 aa  50.4  2e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  8.20152e-09  hitchhiker  3.66748e-05 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02704  hypothetical protein  29.51 
 
 
156 aa  49.7  3e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2813  hypothetical protein  36.44 
 
 
173 aa  48.9  5e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.46224e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1612  hypothetical protein  31.09 
 
 
174 aa  48.5  6e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.08475e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1597  hypothetical protein  29.37 
 
 
175 aa  48.5  6e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.16577  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0163  hypothetical protein  34.17 
 
 
174 aa  47.8  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00796864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2128  hypothetical protein  28.33 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023042  normal  0.0264817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2293  hypothetical protein  34.78 
 
 
170 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1881  protein of unknown function DUF177  42.19 
 
 
185 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0908518  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1084  hypothetical protein  31.3 
 
 
173 aa  46.2  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.181417  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02336  hypothetical protein  33.04 
 
 
220 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  1.24233e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>