More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2132 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  100 
 
 		 440 aa  858    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  74.49 
 
 		 443 aa  653    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  61.67 
 
 		 441 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  59.41 
 
 		 441 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  61.26 
 
 		 442 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  60.24 
 
 		 426 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  61.19 
 
 		 442 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 426 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  60.32 
 
 		 442 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  59.86 
 
 		 441 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  59.86 
 
 		 441 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  59.86 
 
 		 441 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  59.63 
 
 		 441 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  59.86 
 
 		 441 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  59.86 
 
 		 441 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 452 aa  260  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 447 aa  252  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 		 434 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 443 aa  146  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 468 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 465 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 416 aa  140  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 438 aa  132  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 438 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 426 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  30.93 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 506 aa  126  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  28 
 
 		 475 aa  126  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 433 aa  126  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 453 aa  126  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 461 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 439 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 440 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 439 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 418 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 438 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 448 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 439 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 435 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 418 aa  103  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 437 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 440 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 440 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 440 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 441 aa  97.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 440 aa  96.7  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 442 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 440 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 437 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 426 aa  93.2  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 442 aa  92.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  24.88 
 
 		 436 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 467 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 578 aa  90.5  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 449 aa  87  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 449 aa  86.7  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 422 aa  86.7  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 478 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 441 aa  86.7  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 451 aa  86.3  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  27.8 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 454 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  26.74 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  25.84 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  24.44 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.64 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  26.57 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>