More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2106 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  82.26 
 
 		 326 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  63.93 
 
 		 329 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  63.61 
 
 		 329 aa  394  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  59.33 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  60.67 
 
 		 326 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  55.42 
 
 		 420 aa  349  5e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  52.53 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3508  hypothetical protein  52.2 
 
 		 324 aa  318  9e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  48.65 
 
 		 325 aa  308  9e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4039  hypothetical protein  50.51 
 
 		 324 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191923  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.9 
 
 		 330 aa  291  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.82 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  47.83 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  45.2 
 
 		 331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  47.52 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  46.13 
 
 		 333 aa  278  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.08 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.82 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  47.6 
 
 		 325 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.65 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2118  hypothetical protein  44.07 
 
 		 331 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0299117  normal  0.0185863 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  43.29 
 
 		 335 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  46.91 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  44.38 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  45.02 
 
 		 325 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  45.92 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.3 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.15 
 
 		 327 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  42.45 
 
 		 322 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  44.63 
 
 		 330 aa  262  4.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.67 
 
 		 325 aa  262  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.58 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  43 
 
 		 337 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.58 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  44.55 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.04 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.99 
 
 		 328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  44.37 
 
 		 328 aa  258  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  40.5 
 
 		 322 aa  258  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  44.37 
 
 		 328 aa  258  9e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  43.89 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.37 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  42.81 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.19 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  44.44 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  42.81 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  43.14 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.82 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  42.19 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  44.28 
 
 		 330 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.14 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  44.55 
 
 		 356 aa  255  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.62 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  44 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  44.24 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  45.05 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.81 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  45.07 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  41.01 
 
 		 332 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  40.91 
 
 		 334 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.66 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  42.81 
 
 		 353 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  44.22 
 
 		 321 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.63 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  43.71 
 
 		 331 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.28 
 
 		 356 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  42.81 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  45.27 
 
 		 321 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  41.81 
 
 		 304 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.67 
 
 		 335 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  46.79 
 
 		 347 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  43.14 
 
 		 330 aa  249  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.48 
 
 		 345 aa  249  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  41.03 
 
 		 322 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.48 
 
 		 345 aa  248  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 		 329 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  44.19 
 
 		 337 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  42.07 
 
 		 330 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.6 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  41.12 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  43.42 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  42.94 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.65 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  44.41 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  39.27 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  42.2 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  40.88 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.14 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  42.26 
 
 		 330 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.03 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  41.3 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.38 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.38 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  41.85 
 
 		 339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0255  hypothetical protein  46.53 
 
 		 332 aa  245  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  41.58 
 
 		 360 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.53 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>