34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2036 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2036  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  188  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2039  hypothetical protein  59.74 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1202  lipoprotein transmembrane  47.3 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1109  putative lipoprotein transmembrane  47.3 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.862439  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1281  lipoprotein transmembrane  60.38 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0429842  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0458  hypothetical protein  47.69 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.912732  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1358  hypothetical protein  45 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0957605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  42.11 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  38.46 
 
 		 175 aa  50.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1089  hypothetical protein  34.85 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1005  hypothetical protein  34.85 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  32.47 
 
 		 95 aa  48.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  42 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  42 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  42 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  38 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000107723  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0935  hypothetical protein  34.85 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  38 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  38 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000648455  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2216  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316699  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2166  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000514786  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2014  hypothetical protein  36 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0149983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2218  hypothetical protein  42.22 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0257547  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4300  hypothetical protein  36.36 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.486279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1165  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0637  FixH family protein  33.9 
 
 		 166 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2823  hypothetical protein  32.84 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.010351  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1795  hypothetical protein  36 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.390885  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2215  hypothetical protein  31.43 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1991  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  34.62 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>