More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1987 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  437  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 212 aa  177  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 202 aa  175  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 195 aa  158  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  43.92 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 398 aa  78.2  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  27.4 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  28.3 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  53.23 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  31.29 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  25.13 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  25.37 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  26.56 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  27.55 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  26.84 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  21.95 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2712  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 770 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>