More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1960 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  71.68 
 
 		 249 aa  339  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  67.08 
 
 		 250 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  65.04 
 
 		 251 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  59.27 
 
 		 250 aa  288  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  59.59 
 
 		 250 aa  288  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  59.59 
 
 		 250 aa  288  5.0000000000000004e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  60.43 
 
 		 250 aa  287  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  66.96 
 
 		 252 aa  285  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  63.71 
 
 		 253 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  62.9 
 
 		 253 aa  278  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  58.06 
 
 		 252 aa  278  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  57.66 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  63.01 
 
 		 253 aa  275  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  65.71 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  61.67 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  62.45 
 
 		 252 aa  272  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  61.57 
 
 		 252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  55.74 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  55.74 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  55.74 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  55.74 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  55.74 
 
 		 252 aa  268  8e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  59.02 
 
 		 251 aa  268  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  55.74 
 
 		 252 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  55.33 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  55.33 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  62.6 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  56.3 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  56.3 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  56.3 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  56.3 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  56.3 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  62.2 
 
 		 604 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  62.6 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  55.91 
 
 		 262 aa  265  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  56.22 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  56.22 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  56.22 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  56.22 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  57.02 
 
 		 252 aa  265  7e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  55.91 
 
 		 254 aa  264  8.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  55.42 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  56.69 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  63.84 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  58.53 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  57.64 
 
 		 235 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  59.17 
 
 		 250 aa  249  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  45.54 
 
 		 275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  40.59 
 
 		 312 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  40.65 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  38.8 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  41.59 
 
 		 290 aa  153  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  37.28 
 
 		 289 aa  148  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  30.23 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  30.47 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  26.82 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  29.96 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  26.48 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  27.27 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  29.44 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  29.66 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  25.69 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  29.22 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  25.68 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  28.07 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  25.38 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  26.83 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  23.85 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  29.05 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  27.59 
 
 		 269 aa  72  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  27.78 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  28.19 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  28.85 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  26.32 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  26.98 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  24.51 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  28.31 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  27.56 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  25.31 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  33.53 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  27.69 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  27.56 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  30.25 
 
 		 472 aa  69.3  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  30.14 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  26.82 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  25.98 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  25.81 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 		 292 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  27.78 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  27.31 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  30.06 
 
 		 605 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  26.82 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  30.36 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  29.88 
 
 		 573 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  26.57 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  26.82 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  30.95 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  33.53 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0890  peptidase M48, Ste24p  29.45 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397549  normal  0.908613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>