176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1910 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  100 
 
 		 199 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  81.25 
 
 		 177 aa  293  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  73.45 
 
 		 178 aa  279  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  72.57 
 
 		 180 aa  259  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  46.86 
 
 		 181 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  46.89 
 
 		 181 aa  164  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.11 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  47.98 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.23 
 
 		 181 aa  151  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.86 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  46.02 
 
 		 390 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.08 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  48 
 
 		 173 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  43.75 
 
 		 183 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  44.32 
 
 		 183 aa  134  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  43.75 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.75 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  43.75 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  38.86 
 
 		 178 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  41.88 
 
 		 196 aa  125  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.98 
 
 		 177 aa  124  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  37.29 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  34.88 
 
 		 181 aa  121  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  38.01 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.96 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  38.37 
 
 		 178 aa  117  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  37.36 
 
 		 175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  41.71 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.57 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  36.99 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  38.73 
 
 		 180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  33.91 
 
 		 172 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  32.18 
 
 		 176 aa  109  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  37.36 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  37.36 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  36.76 
 
 		 175 aa  107  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  35.84 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  38.25 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  36.99 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.59 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03197  dihydrofolate reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06820)  41.11 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.245608 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.2 
 
 		 174 aa  91.7  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.98 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.59 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  30.29 
 
 		 173 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  32.98 
 
 		 194 aa  86.3  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.46 
 
 		 184 aa  84.7  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  32.57 
 
 		 173 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  30.46 
 
 		 173 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  31.03 
 
 		 173 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  32 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  32 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  31.03 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  29.71 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  32 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.46 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  32.4 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  36.21 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.78 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.22 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.67 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.8 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  32 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  31.89 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.51 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  29.67 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  28.96 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.81 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  28.65 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.33 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.51 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.51 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  29.51 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  26.67 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  28.81 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.06 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.89 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  25.68 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.89 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.93 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  28.42 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.35 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06432  dihydrofolate reductase  38.03 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  26.21 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.25 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.23 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1669  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.98 
 
 		 373 aa  58.2  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.04431e-16 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  28.8 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.38 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.87 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.56 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  25.81 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1542  dihydrofolate reductase region  31.45 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  28.57 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.258312 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>